PubMed training

PubMed training

Waarom deze training?Bron: E. Langhorst, Hogeschool Rotterdam

PubMed is een gratis doorzoekbare databank met referenties van biomedische literatuur. PubMed doorzoekt literatuurreferenties vanaf 1946 en wordt dagelijks bijgewerkt door de National Library of Medicine (NLM) in de VS.

 

Wat kun je vinden in PubMed?

  • Meer dan 25 miljoen verwijzingen naar biomedische referenties
  • 5600 biomedische tijdschriften

 

Tip! Gebruik altijd de toegang tot PubMed via de bibliotheek website.

 

Wat leer je in deze training?

Deze training is gericht op het vergroten van je informatievaardigheden in PubMed. Daarnaast zul je zien dat de zoekstrategie die je maakt in PubMed ook toe te passen is in andere databanken. De training is bedoeld voor studenten van IvG en er is geen specifieke voorkennis nodig om deel te nemen.​

Je leert:

  • zoekwoorden zoeken in de trefwoordenstructuur (MeSH);
  • synoniemen zoeken en gebruiken;
  • een zoekstring maken;

 

Zoekstrategie invulformulier PubMed

Als je literatuur gaat zoeken in PubMed (en je werkt met een PICO) kan het handig zijn om gebruik te gaan maken van het invulformulier zoekstrategie PubMed. Dit invulformulier kun je vinden op de website van de Bibliotheek.

 

Zo werkt het:

De training bestaat uit 9 modules. Iedere module bevat uitleg en soms korte video's. Je kan de modules van begin tot eind doorlopen of onafhankelijk van elkaar doen. Klik op de knop 'Volgende' rechts onderin dit scherm om te starten.

 

 

 

1. Verzamel zoektermen

Bron: HR, E, Langhorst

Vertaal je hoofdvraag en deelvragen naar bruikbare zoektermen waarmee je gaat zoeken naar informatie.

Vind je het lastig om geschikte zoektermen te bedenken? Maak dan gebruik van de volgende tips:

  • Je vindt goede zoektermen door relevante artikelen te scannen op algemene begrippen.
  • Tijdens de oriëntatiefase kom je vaak vakterminologie en Engelse termen tegen. Noteer deze termen alvast.
  • Gebruik woordenboeken om zoektermen te vertalen, bijvoorbeeld naar het Engels
  • Je kunt een synoniemenwebsite raadplegen.
  • PubMed heeft een lijst met gebruikte trefwoorden, een zogenaamde thesaurus.
    In PubMed heet dit: MeSH-termen. MeSH staat voor Medical Subject Heading.
    Hiermee kun je ideeën opdoen voor zoektermen.
  • Gebruik het zoekstrategieformulier PubMed om overzicht te houden tijdens je literatuuronderzoek.

 

1.1 Zoek MeSH-termen

Wat zijn MeSH-termen?

In PubMed kun je zoeken met MeSH-termen via de MeSH Database. MeSH-termen (Medical Subject Headings) zijn gestandaardiseerde trefwoorden, die door indexeerders aan alle artikelen in PubMed worden toegekend. Elk artikel heeft zo'n 10-20 MeSH-termen toegevoegd.

Voordelen van zoeken met MeSH-termen:

  • MeSH-termen worden ook toegekend aan artikelen waarin deze term niet voorkomt maar het onderwerp wel behandelen.
  • MeSH-termen geven inzicht in de synoniemen, deze worden Entry terms genoemd.

Het is dus verstandig om voor de verschillende elementen in je zoekvraag op zoek te gaan naar MeSH-termen.

 

MeSH-database
Je kunt de MeSH database vinden door op de homepagina van PubMed te klikken op MeSH database. Er zal nu een nieuw tabblad openen met de MeSH databank.

Beginscherm van PubMed

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

MeSH Do's  en Don'ts

Do: zoek de zoekterm op in de MeSH Database, en gebruik 'add to search builder' om de MeSH-term te kopiëren naar je zoekformulier.

Don't: Simpelweg [Mesh] typen achter een zoekterm.

 

Voorbeeld

In deze training zullen we gebruik maken van de volgende onderzoeksvraag:

Wat is de invloed van inname van voedingsvezels op obstipatie bij volwassenen?

Voor deze onderzoeksvraag gaan we op zoek naar relevante MeSH-termen voor de elementen obstipatie en voedingsvezels. We beginnen met de MeSH-term voor obstipatie. De MeSH-databank is in het Engels, dus we zoeken op constipation in de zoekbalk. De MeSH-term die we vinden is "Constipation".
Let op! Zorg dat je in de MeSH databank zit. Als bij de rode pijl PubMed staat kun je het menu openklappen en MeSH selecteren.

MeSH pagina van constipation



Om de MeSH-term te gebruiken in een zoekstring kopieer je hem naar het invulformulier zoekstrategie PubMed of een eigen Word document.

Je doet dit door:

  • te klikken op "Add to search builder"
  • het zoekcommando te kopiëren vanuit de PubMed search builder box naar het invulformulier of een Word bestand: "Constipation"[Mesh]
  • klik vervolgens op 'Search PubMed' om te zoeken met de MeSH-term in PubMed
MeSH pagina van constipation

 

1.2 MeSH-termen: kennisclip

Waar vind ik de MeSH databank?

 

Problemen met het kijken van de kennisclip?
Krijg je de foutmelding "Mediasite Player: your playback ticket is not valid for this session", verwijder dan je cookies en speel het filmpje opnieuw af.

 

1.3 MeSH-termen: oefening

1.4 Zoek synoniemen

Bron: HR, E, Langhorst

Naast MeSH-termen zoek je ook altijd op synoniemen, woorden met een gelijke betekenis, die in de titel of samenvatting voorkomen. Op deze manier vind je ook de recente artikelen. Er zit namelijk een vertraging van ongeveer 6 maanden op het toekennen van MeSH-termen aan artikelen door indexeerders. Daarom is het belangrijk om ook op synoniemen te zoeken.

 

Synoniemen bedenken

Synoniemen kun je zelf bedenken, maar je kunt ook gebruik maken van de MeSH databank. Op de webpagina van een MeSH-term staan onder het kopje Entry terms de synoniemen genoemd van deze MeSH term. Direct achter de synoniemen zet je [tiab]. Met dit commando geef je PubMed opdracht om enkel te zoeken naar artikelen waarin het synoniem voorkomt in de titel of abstract (=samenvatting) van het artikel.

 

Voorbeeld

De MeSH-term voor obstipatie is Constipation[Mesh] en op deze pagina zie je onder het kopje Entry terms twee synoniemen staan voor constipation:  

MeSH pagina van constipation. Bij de rode pijl staan de synoniemen onder het kopje 'Entry Terms'.

 

Om de meeste recente literatuur te vinden moet je ook de MeSH-term zelf toevoegen, door hier [tiab] achter te zetten.

De synoniemen van de MeSH Term Constipation zijn dus:

  • Constipation[tiab]
  • Dyschezia[tiab]
  • Colonic Inertia[tiab]

1.5 Synoniemen: kennisclip

Waar vind ik synoniemen?

 

Problemen met het kijken van de kennisclip?
Krijg je de foutmelding "Mediasite Player: your playback ticket is not valid for this session", verwijder dan je cookies en speel het filmpje opnieuw af. 

 

 

 

2. Zoektechnieken

Hoe moet ik zoektermen met elkaar combineren?

Het is niet handig om alle mogelijke zoektermen lukraak in te typen in PubMed.
Om specifieke en gerichte informatie over je onderwerp terug te vinden,
moet je zoektermen met elkaar combineren.

Er zijn verschillende technieken om dit te doen:

  • Booleaanse operatoren
  • Trunkeren
  • Exacte woordcombinatie

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

2.1 Zoeken met Booleaanse operatoren

Booleaanse operatoren (AND, OR, NOT)

AND

  • AND betekent dat alle zoekwoorden in het zoekresultaat moeten voorkomen
  • De AND-relatie gebruik je om twee (of meer) verschillende onderwerpen aan elkaar te linken
  • Het zoekresultaat wordt beperkt, kleiner ten opzichte van het zoeken op één woord
  • Voorbeeld: je bent op zoek naar informatie over de relatie tussen voedingsvezels en obstipatie. Zoektermen en relatie: constipation AND dietary fibers

 

 

 

 

 

 

 


OR

  • OR betekent dat ten minste één van de zoekwoorden voorkomt in het zoekresultaat
  • de OR-relatie gebruik je bij synoniemen, meervoud/enkelvoud, verschillende spellingsvormen
  • Het zoekresultaat wordt vergroot, uitgebreid ten opzichte van het zoeken op één woord
  • Voorbeeld: je wilt ook zoeken op de synoniemen van constipation. Zoektermen en relatie: constipation OR dyschezia

 

 

 

 

 

 

 

 

NOT

  • De NOT-relatie gebruik je om een bepaald woord/onderwerp uit te sluiten
  • het zoekresultaat wordt verkleind
  • Voorbeeld: je wilt informatie over omleidingen rond het hart, maar niet over maagomleidingen.
    Zoektermen en relatie: bypass NOT gastric













Tips!

  • Type AND/OR/NOT met hoofdletters.
  • Combineer je meerdere Booleaanse operatoren, zet de OR-termen dan tussen haakjes.
    Voorbeeld: (Constipation OR dyschezia) AND dietary fibers.
    Gebruik je hier géén haakjes dan werkt het AND commando alléén voor dyschezia AND dietary fibers.

 

 

 

2.2 Hoe werkt trunkeren?

Trunkeren is het vervangen van een stukje van een woord door een * (wildcard). Dit betekent dat je zoekt naar woorden eindigend op het ingetypte woord.

  • Als je een trunkeerteken achter een (gedeelte van een) woord typt, zoek je op wat je hebt ingetypt én alles wat er achter kan staan.
    Voorbeeld: Nurs* zoekt op Nurse en Nurses en Nursing etc
  • Op deze manier kan je handig enkelvoud en meervoud tegelijk doorzoeken
    Voorbeeld: Dietary fiber* zoekt op Dietary fiber en Dietary fibers

 

Let op!
In PubMed werkt trunkeren alleen vanaf 4 letters of meer
Voorbeeld: boy* [tiab] werkt niet.
Dus maak hiervoor zelf een zoekstring: boy[tiab] OR boys[tiab] OR boyhood[tiab]


Tip!

Het is de kunst om niet té vroeg of té laat te trunkeren in een woord.
Zoek je naar informatie over "pollution" typ dan pollut* en niet poll*.

2.3 Zoeken op Exacte woordcombinatie

Wil je alleen zoekresultaten vinden waarin je ingegeven zoektermen in exact dezelfde volgorde voorkomen, zet deze zoektermen dan tussen dubbele aanhalingstekens.

Dit is handig bij begrippen die uit meerdere woorden bestaan, bv. “dietary fiber” Zet je dit begrip niet tussen aanhalingstekens dan vind je ook zoekresultaten die over een ander onderwerp gaan en waarbij de woorden dietary en fiber ergens in de tekst voorkomen.

Meer voorbeelden: "diabetes mellitus”, "food safety", "heart failure", "body weight".

 

Een exacte woordcombinatie is eigenlijk een strenge versie van de Booleaanse AND-operator. De zoektermen moeten wel naast elkaar staan. Een ander verschil is dat de volgorde van de zoektermen niet willekeurig is, maar door jou wordt vastgelegd.

2.4 Hoe krijg ik meer/minder zoekresultaten?

Niemand is bereid om honderden of duizenden zoekresultaten allemaal afzonderlijk te beoordelen op hun relevantie. Het is beter om zo te zoeken dat je maximaal enkele tientallen zoekresultaten krijgt, zonder relevante zoekresultaten overboord te gooien.

Wat kan je doen als je veel te veel zoekresultaten krijgt?Beeld: E. Langhorst, Hogeschool Rotterdam

  • Gebruik andere zoektermen
  • Kijk welke (betere?) Mesh-termen er zijn gebruikt in een revelant artikel
  • Combineer belangrijke zoektermen met de Booleaanse AND-operator
  • Wees kritisch op het gebruik van de OR-operator
  • Trunkeer zo laat mogelijk in een woord; trunke*
  • Gebruik de Filters zo laat mogelijk om af te bakenen.
    Let op: als je eenmaal een filter hebt aangezet houd PubMed dit vast en moet je die dus bij een volgende zoekaktie eerst zelf 'uitvinken'


Het is frustrerend om geen zoekresultaten te krijgen.

Wat kan je doen als je weinig of geen zoekresultaten krijgt?Beeld: E. Langhorst, Hogeschool Rotterdam

  • Gebruik andere zoektermen.
  • Combineer synoniemen en vertalingen met de Booleaanse OR-operator.
  • Kijk welke Mesh-termen er zijn gebruikt in een revelant artikel.
  • Zoek breder: Kijk bij de Mesh in de structuur naar hogere termen.
  • Heb je gezocht op [Mesh] OR [tiab]? Zoek dan ook eens zonder deze aanduiding en kijk bij de gevonden artikelen welke Mesh-termen er daar zijn gebruikt.
  • Sneeuwballen; bekijk de literatuurlijst van een relevante bron om meer bronnen te vinden
  • Probeer andere bronnen

3. Zoekstring maken

Je kunt de zoektermen (MeSH-termen en synoniemen) met elkaar combineren door de juiste combinaties van Booleaanse operatoren en ronde haken te gebruiken.

 

Er zijn 2 manieren om MeSH termen en synoniemen te combineren.

  1. Met PubMed Advanced Search Builder. Deze optie wordt uitgelegd in 3.1 en 3.2.
  2. Met Word. Deze optie wordt uitgelegd in 3.3 en 3.4.

Met beide opties bereik je hetzelfde zoekresultaat. Een voordeel van de tweede optie is dat je hier je zoekstring gemakkelijker kunt bewaren, aanpassen en herbruiken.
Het is een kwestie van persoonlijke voorkeur of je de Advanced Search Builder of Word gebruikt.

3.1 Advanced search builder

PubMed Advanced Search Builder is een handig hulpmiddel voor het op de juiste plaats krijgen van haakjes en het gebruik van booleaanse operatoren.

Hieronder wordt uitgelegd hoe dit werkt als je een zoekstring wilt maken voor de onderzoeksvraag "Wat is de invloed van inname van voedingsvezels op obstipatie bij volwassenen?"

Stappenplan PubMed Advanced Search Builder

 

Stap 1: Open PubMed Advanced

 

 

 

 

 

 

 

Stap 2: Bij “History and Search details” staat de zoekactie naar de MeSH-term (zie 1.1 van deze training) voor het onderdeel constipatie uit de onderzoeksvraag.

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Stap 3: Voeg de synoniemen toe (zie 1.4 van deze training)

  • Selecteer Title/Abstract aan de linkse kant
  • Type (of kopieer) één van de synoniemen in de bovenste zoekbalk en klik op 'Add' en 'Search'

 

 

 

 

 

 

 

  • Het synoniem staat nu bij de "History and search details"

 

 

 

 

 

  • Als je meer synoniemen wilt toevoegen kun je dit doen op dezelfde manier. In het voorbeeld voegen we nog de synoniemen "Colonic Inertia" en Constipation toe. Constipation is uiteraard hetzelfde als de MeSH-term, maar door ook deze op titel en abstract te doorzoeken vind je de de meest recente literatuur.

 

 

 

 

 

 

 

Stap 4: Combineer de MeSH-term en synoniem(en) met elkaar

  • Gebruik hiervoor de 3 puntjes onder 'Actions'.
  • Kies bij de MeSH-term voor 'Add query'.
  • Bij het toevoegen van synoniemen kies je 'Add with OR'
  • Klik als je alle synoniemen hebt toegevoegd op 'Search'

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Stap 5: Maak met behulp van stappen 1 t/m 4 ook een zoekstring voor het onderdeel voedingsvezels.

Bij search #10 zie je de zoekstring staan voor voedingsvezels.

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Stap 6: Combineer de twee onderdelen (constipatie en vezels) met elkaar.

  • Gebruik hiervoor de 3 puntjes onder 'Actions'.
  • Kies bij het eerste onderdeel (= constipatie) voor 'Add query'.
  • Bij het toevoegen van extra onderdelen (= voedingsvezels) kies je 'Add with AND'
  • Klik als je alle onderdelen hebt toegevoegd op 'Search'

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Resultaat

Bij search #11 staat nu de zoekstring voor de onderzoeksvraag "Wat is de invloed van inname van voedingsvezels op obstipatie bij volwassenen?"

3.2 Kennisclip Advanced search builder

Zoekstring maken met PubMed Advanced Search Builder

Hier leer je Mesh-termen en synoniemen te combineren met PubMed Advanced Search.
Dit is een handige manier om veldaanduidingen, haakjes en booleaanse operatoren op de juiste plaats te krijgen.

 

Problemen met het kijken van één van de kennisclips?
Krijg je de foutmelding "Mediasite Player: your playback ticket is not valid for this session", verwijder dan je cookies en speel het filmpje opnieuw af.

3.3 Word

De tweede manier om een zoekstring te maken is door gebruik te maken van Word.
Maak eventueel gebruik van het invulformulier PubMed, dat op de website van de Bibliotheek staat.

 

Hieronder wordt uitgelegd hoe je een zoekstring maakt in Word voor de onderzoeksvraag "Wat is de invloed van inname van voedingsvezels op obstipatie bij volwassenen?"

Stappenplan zoekstring in Word

 

Stap 1: Identificeer de verschillende onderdelen in de onderzoeksvraag.

De voorbeeldonderzoeksvraag had de volgende elementen:

  1. Constipation
  2. Dietary Fibers

 

Stap 2: Begin met de MeSH term (zie 1.1 van deze training)

  • Klik op 'Add to search builder'
  • Kopieer de zoekterm vanuit de PubMed Search Builder box
    Voorbeeld: "Constipation"[Mesh]

 

 

Stap 3: Synoniemen van MeSH-term toevoegen

  • Het eerste synoniem dat je toevoegt is de MeSH-term zelf. Deze zoekterm is uiteraard hetzelfde als de MeSH-term, maar door ook deze op titel en abstract te doorzoeken vind je de de meest recente literatuur. Er zit namelijk een vertraging op het toekennen van MeSH-termen.
  • Achter de zoekterm typ je [tiab], dit staat voor title/abstract.
    Voorbeeld: Constipation[tiab]
  • Combineer de MeSH-term uit stap 1 met zijn synoniem hierboven. Tussen de MeSH-termen en synoniemen gebruik je OR.
    Voorbeeld: "Constipation"[Mesh] OR Constipation[tiab]

 

Stap 4: Voeg eventueel andere synoniemen toe (zie 1.4 van deze training)

  • Kopieer de synoniemen onder 'Entry Terms' op de MeSH-pagina van Constipation

  • Maak gebruik van de zoektechnieken, trunkeren en exacte woordcombinatie, en zet achter de synoniemen [tiab]. Tussen synoniemen zet je de booleaanse operator OR.
    Voorbeeld: Dyschezia[tiab] OR "Colonic Inertia"[tiab]
  • Voeg deze synoniemen toe aan de zoekstring van stap 3.
    Voorbeeld: "Constipation"[Mesh] OR Constipation[tiab] OR Dyschezia[tiab] OR "Colonic Inertia"[tiab]

 

Stap 5: Plaats ronde haken

  • Plaats ronde haken aan het begin en einde van een onderdeel, dit doe je zodat deze zoektermen bij elkaar blijven.
    Voorbeeld: ("Constipation"[Mesh] OR Constipation[tiab] OR Dyschezia[tiab] OR "Colonic Inertia"[tiab])

 

Stap 6: Maak een zoekstring voor een ander onderdeel

  • Herhaal stappen 1 t/m 5 voor het maken van een zoekstring voor het onderwerp voedingsvezels.
    Voorbeeld: ("Dietary Fiber"[Mesh] OR “Dietary Fiber*”[tiab] OR “Wheat Bran*”[tiab] OR Roughage*[tiab])
  • Tip! Entry terms die omkeringen zijn van vorige kan je verwijderen. Zo gebruik je "Dietary fibers" in je zoekstring en haal je "Fibers, Dietary" weg.

 

Stap 7: Combineer de twee onderdelen (constipatie en vezels) met elkaar.

  • Tussen de verschillende onderwerpen (aspecten) van een onderzoeksvraag gebruik je AND
  • Voorbeeld: (Constipation[Mesh] OR Constipation[tiab] OR Dyschezia[tiab] OR "Colonic Inertia"[tiab]) AND ("Dietary Fiber"[Mesh] OR "Dietary Fiber*"[tiab] OR "Wheat Bran*"[tiab] OR Roughage*[tiab])

 

 

Resultaat

(Constipation[Mesh] OR Constipation[tiab] OR Dyschezia[tiab] OR "Colonic Inertia"[tiab]) AND ("Dietary Fiber"[Mesh] OR "Dietary Fiber*"[tiab] OR "Wheat Bran*"[tiab] OR Roughage*[tiab])

3.4 Kennisclip Word

Zoekstring maken in Word

Hier leer je het combineren van zoektermen in Word met behulp van MeSH-termen.

 

 

Problemen met het kijken van één van de kennisclips?
Krijg je de foutmelding "Mediasite Player: your playback ticket is not valid for this session", verwijder dan je cookies en speel het filmpje opnieuw af.

4. Zoeken met een zoekstring

Hoe kan ik zoeken met een zoekstring in PubMed?

Je kunt de zoekstring die je gemaakt hebt in onderdeel 3 gebruiken om te zoeken in PubMed. Hoe je dat doet, wordt uitgelegd in dit deel van de training.

 

Kan ik mijn gemaakte zoekstring ook gebruiken in andere databanken?

Ja dat kan! Met enkele kleine aanpassingen aan de PubMed zoekstring kan je deze ook gebruiken in andere databanken. In deze training wordt voor de databanken Ebscohost (CINAHL), Cochrane Library en Springer Link uitgelegd hoe je dit kunt doen.

4.1 Zoeken in PubMed

Zoeken in PubMed kun je het gemakkelijkste doen via Advanced Search.

Hieronder wordt uitgelegd hoe je kunt zoeken met de zoekstring die gemaakt is onderdeel 3 van deze training.

 

Stappenplan zoeken in PubMed met een zoekstring

 

Stap 1: Open PubMed Advanced

 

 

 

 

 

 

 

  • ​Heb je de Advanced Search builder (zie onderdeel 3.1) gebruikt om je zoekstring te maken ga naar stap 2a.
  • Heb je Word (zie onderdeel 3.3) gebruikt om je zoekstring te maken ga naar stap 2b.  

 

Stap 2a: Zoekstring bij 'History and Search Details'

  • Heb je de Advanced Search builder (zie onderdeel 3.1) gebruikt om je zoekstring te maken, dan staat je gemaakte zoekstring al bij 'History and Search Details'.
  • Klik op het aantal results om je resultaten (de gevonden artikelen) te bekijken.

 

 

 

 

 

 

 

Stap 2b: Kopieer je zoekstring in de Query box

  • Heb je Word (zie onderdeel 3.3) gebruikt om je zoekstring te maken, kopieer je zoekstring en plak deze in de 'Query box'
  • Klik op 'Search'

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Stap 3: Bekijk je resultaten

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Bekijk je resultaten. Zitten er relevante artikelen tussen die een antwoord geven op je onderzoeksvraag?
Zo niet, stel jezelf de volgende vragen:

  • Is er een zoekterm die geen goede artikelen oplevert? Haal deze eens uit je zoekstring en kijk wat dat doet met resultaten. Kijk daarnaast ook eens naar de eerste paar titels van de gevonden artikelen om zo betere zoektermen te vinden.
  • Kun je nog verder specificeren, bv door het toevoegen van een doelgroep of een specifiekere zoekterm?
    Voorbeeld: stel je zoekt informatie over diabetes type 1. Je hebt in je zoekstring enkel de zoekterm 'diabetes' staan, deze kun je specifieker maken door te zoeken naar "diabetes type 1"
  • Staat het trunkeerteken te vroeg, waardoor je onrelevante woordvarianten hebt gevonden?

​In onderdeel 2.4 van deze training staan nog meer tips om je zoekresultaten te vergroten of te verkleinen.

4.2 Zoeken in andere databanken

Kan ik de zoekstring die ik gemaakt heb in PubMed ook gebruiken in andere databanken?

 

Ja! Je kan de zoekstring die je in PubMed hebt gemaakt ook gemakkelijk gebruiken in andere databanken.

Hiervoor pas je het volgende aan:

  • Verwijder de veldaanduidingen [MeSH] en [tiab]
  • Conroleer of alle samengestelde trefwoorden tussen "dubbele aanhalingstekens" staan
    Voorbeeld: "Dietary Fiber"

 

Voorbeeld zoekstring aanpassen

PubMed zoekstring gemaakt met Word:
(Constipation[Mesh] OR Constipation[tiab] OR Dyschezia[tiab] OR "Colonic Inertia"[tiab]) AND ("Dietary Fiber"[Mesh] OR "Dietary Fiber*"[tiab] OR "Wheat Bran*"[tiab] OR Roughage*[tiab])

Stap 1: Verwijder [MeSH] en [tiab] aanduidingen.
(Constipation[Mesh] OR Constipation[tiab] OR Dyschezia[tiab] OR "Colonic Inertia"[tiab]) AND ("Dietary Fiber"[Mesh] OR "Dietary Fiber*"[tiab] OR "Wheat Bran*"[tiab] OR Roughage*[tiab])

Stap 2: Verwijder dubbelingen.
(Constipation OR Constipation OR Dyschezia OR “Colonic Inertia”) AND (“Dietary Fiber” OR “Dietary Fiber*” OR “Wheat Bran*” OR Roughage*)

Stap 3: Controleer of samengestelde trefwoorden tussen "dubbele aanhalingstekens".

 

Resultaat aangepaste zoekstring:
(Constipation OR Dyschezia OR “Colonic Inertia”) AND (“Dietary Fiber*” OR “Wheat Bran*” OR Roughage*)

 

 

 

4.2.1 EBSCOMedical (CINAHL)

Voordelen van het zoeken in EBSCOMedical

  • In de EBSCOMedical zitten veel full-text artikelen.
  • Je kunt tegelijkertijd zoeken in 4 databanken, namelijk CINAHL Complete, MEDLINE Complete, Nursing & Allied Health Collection en Psychology and Behavioral Sciences Collection.

 

Zoeken in EBSCOhost

 

Stap 1: Open EBSCOMedical

 

Stap 2: Plak de aangepaste zoekstring in de zoekbalk

  • Knip en plak het eerste aspect van je zoekvraag (Constipation OR Dyschezia
    OR “Colonic Inertia”) in de 1ste zoekbox.
  • Knip en plak (“Dietary Fiber*” OR “Wheat Bran*” OR Roughage*) in de 2e zoekbox.
  • Zorg ervoor dat je de juiste Boolean Operator selecteert, in dit geval AND

 

Tips:

  • Gebruik bij "All fields" de mogelijkheid om je zoekactie de specificeren.
  • Zoeken in "Abstract" en/of "Title" geeft bijvoorbeeld een specifieker resultaat als het zoeken in "All fields"

4.2.2 Cochrane Library

Zoeken in Cochrane library

PubMed en Cochrane library maken gebruik van dezelfde MeSH-databank. Echter moet je wel de MeSH-termen en synoniemen opnieuw opzoeken in de Cochrane Library.

 

Zoeken van MeSH-termen

Ga naar het tabblad Medical terms (MeSH) en geef in de zoekbalk de MeSH-term in die je gebruikt hebt in je PubMed zoekstring. Voorbeeld: Constipation.
Klik vervolgens op look up (1) en add to search manager (2).

 

Zoeken van synoniemen

De synoniemen zoek je op in het tabblad Search. Noteer in de zoekbalk de synoniemen die je gebruikt hebt in je PubMed zoekstring. Vervolgens klik je op Send to search manager.
Let op!

  • Haal [tiab] weg
  • * en "...." kun je wel laten staan   

 

MeSH-termen en synoniemen combineren

Voor het combineren van de MeSH-termen en de synoniemen kijk je bij het tabblad Search manager. Hier staat nu de MeSH-term Constipation in veld #1 en de synoniemen in veld #2. Deze twee velden kun je met elkaar combineren met de Booleaanse operator OR door in veld #3 te noteren: #1 OR #2.
Vervolgens klik je op continue voor het resultaat van je zoekopdracht.

 

Tip: Het zoeken in Cochrane levert vaak weinig andere artikelen op die je niet al PubMed hebt gevonden.

4.2.3 Springer Nature Link

 

Zoeken in Springer Nature Link

Gebruik voor het zoeken in Springer Nature Link de eerste zoekbalk op de startpagina van de databank.
Knip en plak hierin de gehele zoekstrategie (let op: zonder [Mesh] en [tiab]). Gebruik het loepje om de zoekactie te starten.

Tip! Springer Link bevat naast Engelse ook Nederlandse literatuur, als je deze ook wilt vinden, vertaal dan je zoektermen in het Nederlands en voeg die toe met OR.

Let op: Je zoekt in Springer Nature Link alleen in de literatuur die is uitgegeven door de uitgever Springer, probeer altijd artikelen te vinden vanuit meerdere bronnen.

5. Tips & Tricks

5.1 Filters

Filters

Filters in PubMed

Wanneer je te veel resultaten krijgt, kun je via filters je zoekactie verder inperken. Je voert hiervoor eerst de zoekactie uit en vervolgens kun je in de linkerbalk een aantal filters aanklikken. Door deze filters in te stellen zoekt PubMed alleen binnen bepaalde soorten publicaties of binnen bepaalde tijdsperiodes.

Let op! Maak voor een compleet literatuuronderzoek alleen gebruik van de  filters: Systematic Review (publicationtype), Date (publicatiedatum) en Language (taal). Maak ook geen gebruik van de filter "Free full text"!

 

Additional Filters

Onder de knop 'Show additional filters' zijn nog meer filters beschikbaar, bijvoorbeeld taal en leeftijdsgroepen. Door hier de filters van je voorkeur aan te klikken worden ze aan de linkerzijde geplaatst zodat je ze kan aanvinken voor het inperken van je zoekresultaat.

Age filter activeren door het aanvinken van leeftijdsgroepen

 

 

Tips!

  • Veel filters zijn gebaseerd op MeSH-termen. Daardoor kun je
    veel recente, nog niet-geïndexeerde artikelen missen.
    Wil je geen nieuwe literatuur missen? Maak dan alleen gebruik van de standaard filters: Systematic Review (publicationtype), Date (publicatiedatum) en Language (taal).
    Meer weten over filters? Kijk dan in de training Evidence Based Practice.
  • Filters die je instelt voor je zoekactie blijven geldig voor alle volgende zoekacties die je doet. Ze worden enkel inactief als je ze zelf verwijdert.
  • Gebruik enkel filters als je te veel resultaten krijgt. Het gebruik van filters zorgt namelijk voor een sterke inperking van je resultaten.
  • Gebruik niet het filter 'Free full text'. Als je dit filter gebruikt sluit je namelijk niet-full text resultaten uit, waardoor je veel relevante informatie zult missen.

5.2 Verwijzen

Cite

De knop 'Cite' (aan de rechterkant van een geopend artikel) geeft een titelbeschrijving van het artikel welke gebruikt kan worden in de literatuurlijst. Selecteer Format "APA" rechtsonderaan voor een beschrijving volgens de APA regels.

 

Permalink

De knop geeft een directe link naar het artikel, gebruik deze als je snel toegang tot het artikel wilt geven.

Cite en Permalink

5.3 Zoekresultaten sorteren

Display options

De knop 'Display options' (rechtsboven in de resultatenlijst) geeft de mogelijkheid om het resultaat te sorteren.
Kies "Most recent" voor een overzicht op datum waarop de artikelen zijn toegevoegd aan de PubMed database.
Kies "Best match" voor een overzicht met de meest relevante artikelen eerst.

Display options

 

 

5.4 Clinical Queries

Naast de filters kun je ook gebruik maken van vooraf ingestelde zoekfilters. Je vindt deze door op het beginscherm van PubMed onder 'Find' te klikken op de optie Clinical Queries.

Klik op Clinical Queries
in het beginscherm van
PubMed

Er zal nu een scherm openen met een grijze zoekbalk 'Please enter search term(s)'. In deze zoekbalk voer je je PubMed zoekstring in. Na het invoeren hiervan krijg je onder de balk drie filters te zien:

1. Clinical Study Categories. Hier kun je aangegeven naar welk type onderzoek je wilt zoeken, bijvoorbeeld etiology, diagnosis, therapy, prognosis of clinical prediction guides. Ook kun je aanklikken of je zoekactie broad moet zijn, dat wil zeggen sensitief (= je krijgt dan veel resultaten, waarvan veel niet relevant). Of dat je zoekactie narrow moet zijn, dat wil zeggen specifiek (= je krijgt dan minder resultaten, maar relevantere).

2. Systematic Reviews. Via dit filter vind je gemakkelijk systematic reviews voor je zoekactie. Onder deze filter vallen systematic reviews, meta-analyses, reviews van clinical trials en guidelines.

3. Medical Genetics. Met deze clinical querie filter kun je filteren op het onderwerp medische genetica. Daarnaast kun je ook nog kiezen voor andere onderwerpen binnen dit thema, waaronder diagnose en genetisch testen.

5.5 Zoekstring opslaan

Hoe sla ik mijn zoekstring op?

 

 

Problemen met het kijken van de kennisclip?
Krijg je de foutmelding "Mediasite Player: your playback ticket is not valid for this session", verwijder dan je cookies en speel het filmpje opnieuw af.

6. Full text

Hoe vind je de full text van een in PubMed gevonden artikel?

PubMed is een bibliografische databank, dit houd in dat er voornamelijk beschrijvingen van literatuur in PubMed opgenomen worden en geen full text. Daarom is er aan de toegang naar PubMed via de bibliotheek een linkresolver toegevoegd. Deze zorgt ervoor dat er bij de artikelen die je vindt in PubMed een link komt naar de artikelen die wel full text aanwezig zijn in andere databanken waar de bibliotheek een licentie voor heeft.

Tip! Gebruik dus altijd de toegang tot PubMed via de bibliotheek.

 

Doorloop de volgende stappen voor full text:

1. PubMed bevat ook gratis Open Access artikelen.
Maak er gebruik van als het kan, sorteer hier echter niet op, dit doet afbreuk aan het resultaat van je zoekaktie.

2. Door de linkresolver wordt er een full-text "START" knop in PubMed knop bij ieder zoekresultaat in PubMed geplaatst. Hiermee krijg je direct het volledige artikel wanneer dit beschikbaar is in een andere databank van de bibliotheek.

3. Check of het artikel elders online beschikbaar is via Google Scholar. Knip en plak eenvoudigweg de titel van het PubMed artikel in de zoekbalk van Google Scholar.

4. Is het artikel op geen van de voorgaande manieren te vinden. Keer dan terug via de full-text "START" knop in PubMed knop, naar de WorldCat Linkresolver pagina. Hier kun je het artikel aanvragen via IBL met de IBL knop voor het aanvragen van full-text knop. De HR bibliotheek gaat het artikel dan voor je opvragen bij een andere bibliotheek.

 

Tip! Werk je buiten de Hogeschool gebouwen dan is het handig om de Library Access plug-in aan je browser toe te voegen, dan heb je overal eenvoudig toegang tot full text artikelen in de databanken van de bibliotheek.

 

 

 

7. Hulpmiddel: EndNote

Bibliografische software

Wanneer je een onderzoeksopdracht of scriptie maakt, verzamel je veel informatie. Om het overzichtelijk te houden én automatische verwijzingen te maken, kun je bibliografische software gebruiken.

Er zijn gratis online tools die een verwijzing genereren die je kan kopiëren. Met de meer geavanceerde programma's kan je literatuurverwijzingen en pdf-documenten verzamelen, opslaan, delen en organiseren. Je bewaart op deze manier je eigen bibliografische databank met referenties. Daarnaast bieden deze programma’s meestal een plug-in waarmee je literatuurlijsten en tekstverwijzingen in Word kunt invoegen. Word heeft ook een eigen ingebouwde referentie functie. Deze biedt minder mogelijkheden dan bibliografische software. Hogeschool Rotterdam heeft een licentie afgesloten voor het programma EndNote.

 

EndNote

EndNote is bibliografische software waarmee je automatisch verwijzingen en literatuurlijsten kunt maken in een citatiestijl naar keuze. Met het programma houd je overzicht over je verzamelde informatie. EndNote ondersteunt meer dan 500 stijlen, waaronder APA en MLA. Studenten en medewerkers van Hogeschool Rotterdam kunnen EndNote gratis installeren via Liquit.


Kijk voor toegang tot EndNote en meer informatie op de bibliotheekwebsite onder Tools.

 

8. English

International students who are searching in PubMed could use the PubMed User Guide or the English PubMed Online Training for support.  

9. Support

Heb je hulp nodig bij je zoekstrategie in PubMed aarzel dan niet om contact op te nemen met de bibliotheek. Kijk voor contact gegevens op https://hr.nl/bibliotheek  

 

Do you need help with your PubMed search? Do not hesitate to contact the library.

 

 

Begrippenlijst

Term

Uitleg

Meer informatie

Abstract

Korte samenvatting van een artikel, deze staat vaak bovenaan het artikel na de vermelding van titel en auteurs

 

Aspect

Onderwerp / Onderdeel van je vraag

 

Auteur

De schrijver(s) van een publicatie zoals een artikel of een boek

 

Bibliografie

De gegevens die je nodig hebt om een artikel, boek etc. te vinden, o.a. titel, auteur, jaar van uitgave, isbn

7

Booleaanse operatoren/Boolean operator

Combinaties tussen zoektermen: AND - OR - NOT

2.1

Bronverwijzen

Een manier om gebruikte literatuur in een artikel te vermelden

7

Citatie

Verwijzing naar gebruikte literatuur

7

Citatiestijl

Specifieke manier om een verwijzing te noteren (bijvoorbeeld APA)

7

Databank

Verzameling van digitale (literatuur) gegevens

training literatuuronderzoek 2.4

Deelvraag

Vragen waarop je een antwoord wilt vinden om de hoofdvraag te kunnen beantwoorden

training literatuuronderzoek 1.8

Entry term

Synoniem / Ander woord met gelijke betekenis

1.4

Filters

Standaard zoekwoorden/zoekopdrachten waarmee je het resultaat van je zoekaktie kleiner maakt

5.1

Full tekst

De volledige tekst van een artikel

6

Hoofdvraag

Omschrijving wat je precies wilt weten in vraagvorm.

training literatuuronderzoek 1.6

Indexeren / indexeerders

Experts / wetenschappers op een onderwerpsgebied die trefwoorden toekennen aan artikelen/boeken

 

Informatievaardigheden

Alles wat je moet weten om goed naar literatuur te kunnen zoeken en verwijzen

 

Keyword

Trefwoord; een kenmerkend woord waarop je kunt zoeken naar literatuur

 

Literatuur

Artikelen, boeken, rapporten en andere geschreven uitingen waarin het resultaat van (wetenschappelijk) onderzoek of de stand van zaken in de wetenschap wordt gepubliceerd

 

Literatuurlijst

Lijst met gebruikte artikelen, boeken en andere gepubliceerde uitingen

training literatuuronderzoek 5

Literatuuronderzoek

Het op een gestructureerde manier zoeken naar literatuur in databanken

 

MeSH

Medical Subject Heading; een trefwoord welke door een expert aan een artikel is gehangen (vergelijkbaar met een ''tag")

1.1

Onderzoeksvraag

Hoofdvraag / Wat je te weten wilt komen.

training literatuuronderzoek 1 en "Voor je begint"

Phrase zoeken / Phrase searching

Zoeken naar 2 woorden die bij elkaar horen (zoals "Diabetes mellitus" of "Hogeschool Rotterdam")

2.3

PICO

Methode om informatie te vinden bij een onderzoeksvraag welke uitgaat van : Patient - Intervention- Comparison - Outcome

training evidence based practice 1.1

Referentie

(Literatuur-)verwijzing bestaande uit informatie om de literatuur terug te vinden, zoals titel, auteur, jaar van uitgave.

7

Specifiek / specificeren

Precies (maken)

 

Synoniem

Een ander woord met een gelijke betekenis (bijvoorbeeld: interventie - ingreep - tussenkomst)

 1.4

Thesaurus

Lijst met gebruikte trefwoorden in rangorde van groot naar klein

 

tiab

Afkorting voor titel - abstract. Wordt gebruikt als [tiab] of [Title/Abstract], hiermee wordt aangegeven dat PubMed alleen moet zoeken naar de zoekterm in het titel en abstract-veld.

1.4

Trefwoord

Een belangrijk woord of begrip

 

Trunkeren / Trunceren

Vervangen van een stukje van de zoekterm door een * (sterretje). Je zoekt dan naar het woord wat je intyped en alles wat erachter komt (bijvoorbeeld nurs* zoekt naar nurse/nurses/nursing etc.)

2.2

Velden / veldaanduidingen

Datgene waar de databank de zoekterm in moet vinden, zoals titel/abstract/Mesh

 

Vrije tekst termen

Trefwoorden waarop je in PubMed zoekt die niet voorkomen als MeSH-termen

1.4

Zoekbalk

Meestal langwerpig blok waarin je je zoektermen kan typen

 

Zoekcommando

Zoekvraag aan de databank

4.2

Zoekelement

De verschillende onderdelen van je zoekvraag

 

Zoekresultaat

Uitkomst van een zoekactie naar literatuur

 

Zoekstrategie / Zoekstring

Een verzameling van zoekwoorden, booleaanse combinaties, phrases en truncatie waarmee je een databank doorzoekt

4.1

Zoektermen

Woorden waarop je wilt zoeken naar literatuur

 

  • Het arrangement PubMed training is gemaakt met Wikiwijs van Kennisnet. Wikiwijs is hét onderwijsplatform waar je leermiddelen zoekt, maakt en deelt.

    Auteur
    Team IvG support Hogeschool Rotterdam
    Laatst gewijzigd
    2025-07-24 17:27:12
    Licentie

    Dit lesmateriaal is gepubliceerd onder de Creative Commons Naamsvermelding 4.0 Internationale licentie. Dit houdt in dat je onder de voorwaarde van naamsvermelding vrij bent om:

    • het werk te delen - te kopiëren, te verspreiden en door te geven via elk medium of bestandsformaat
    • het werk te bewerken - te remixen, te veranderen en afgeleide werken te maken
    • voor alle doeleinden, inclusief commerciële doeleinden.

    Meer informatie over de CC Naamsvermelding 4.0 Internationale licentie.

    Bronnen:

    Libguides RUG: https://libguides.rug.nl/c.php?g=531668&p=3637442

    Stappenplan Zoekstrategie, Bibliotheek Hogeschool Rotterdam: Zoekstrategie

    Training Stappenplan literatuuronderzoek, Bibliotheek Hogeschool Rotterdam: https://maken.wikiwijs.nl/131972/Training__Stappenplan_literatuuronderzoek

     

    Aanvullende informatie over dit lesmateriaal

    Van dit lesmateriaal is de volgende aanvullende informatie beschikbaar:

    Toelichting
    Zelfstandig te doorlopen training gericht op het vergroten van informatievaardigheiden in PubMed. De training bestaat uit 5 modules. Iedere module bevat uitleg en soms korte video's. Je kan de modules van begin tot eind doorlopen of onafhankelijk van elkaar doen.
    Leerniveau
    HBO - Master; HBO - Bachelor;
    Eindgebruiker
    leerling/student
    Moeilijkheidsgraad
    gemiddeld
    Trefwoorden
    informatievaardigheid, literatuuronderzoek, pubmed, zoekmethodes, zoektechnieken

    Gebruikte Wikiwijs Arrangementen

    Team Informatievaardigheid Hogeschool Rotterdam. (z.d.).

    Training: Stappenplan literatuuronderzoek

    https://maken.wikiwijs.nl/131972/Training__Stappenplan_literatuuronderzoek

  • Downloaden

    Het volledige arrangement is in de onderstaande formaten te downloaden.

    Metadata

    LTI

    Leeromgevingen die gebruik maken van LTI kunnen Wikiwijs arrangementen en toetsen afspelen en resultaten terugkoppelen. Hiervoor moet de leeromgeving wel bij Wikiwijs aangemeld zijn. Wil je gebruik maken van de LTI koppeling? Meld je aan via info@wikiwijs.nl met het verzoek om een LTI koppeling aan te gaan.

    Maak je al gebruik van LTI? Gebruik dan de onderstaande Launch URL’s.

    Arrangement

    Oefeningen en toetsen

    MeSH termen

    IMSCC package

    Wil je de Launch URL’s niet los kopiëren, maar in één keer downloaden? Download dan de IMSCC package.

    QTI

    Oefeningen en toetsen van dit arrangement kun je ook downloaden als QTI. Dit bestaat uit een ZIP bestand dat alle informatie bevat over de specifieke oefening of toets; volgorde van de vragen, afbeeldingen, te behalen punten, etc. Omgevingen met een QTI player kunnen QTI afspelen.

    Versie 2.1 (NL)

    Versie 3.0 bèta

    Voor developers

    Wikiwijs lesmateriaal kan worden gebruikt in een externe leeromgeving. Er kunnen koppelingen worden gemaakt en het lesmateriaal kan op verschillende manieren worden geëxporteerd. Meer informatie hierover kun je vinden op onze Developers Wiki.

  • Gebruik
    Weergave
  • Wikiwijs is een dienst van