PubMed is een gratis doorzoekbare databank met referenties van biomedische literatuur. PubMed doorzoekt literatuurreferenties vanaf 1946 en wordt dagelijks bijgewerkt door de National Library of Medicine (NLM) in de VS.
Wat kun je vinden in PubMed?
Meer dan 25 miljoen verwijzingen naar biomedische referenties
5600 biomedische tijdschriften
Tip!Gebruik altijd de toegang tot PubMed via de mediatheek website.
Wat leer je in deze training?
Deze training is gericht op het vergroten van je informatievaardigheiden in PubMed. Daarnaast zul je zien dat de zoekstrategie die je maakt in PubMed ook toe te passen is in andere databanken. De training is bedoeld voor HBO-studenten van IvG en er is geen specifieke voorkennis nodig om deel te nemen.
Je leert:
zoekwoorden zoeken in de trefwoordenstructuur (MeSH);
synoniemen zoeken en gebruiken;
een zoekstring maken;
Zoekstrategie invulformulier PubMed
Als je literatuur gaat zoeken in PubMed (en je werkt met een PICO) kan het handig zijn om gebruik te gaan maken van het invulformulier zoekstrategie PubMed. Dit invulformulier kun je vinden op de website van de Mediatheek.
Zo werkt het:
De training bestaat uit 9 modules. Iedere module bevat uitleg en soms korte video's. Je kan de modules van begin tot eind doorlopen of onafhankelijk van elkaar doen. Klik op de knop 'Volgende' rechts onderin dit scherm om te starten.
1. Verzamel zoektermen
Vertaal je hoofdvraag en deelvragen naar bruikbare zoektermen waarmee je gaat zoeken naar informatie.
Vind je het lastig om geschikte zoektermen te bedenken? Maak dan gebruik van de volgende tips:
Je vindt goede zoektermen door relevante artikelen te scannen op algemene begrippen.
Tijdens de oriëntatiefase kom je vaak vakterminologie en Engelse termen tegen. Noteer deze termen alvast.
Gebruik woordenboeken om zoektermen te vertalen, bijvoorbeeld naar het Engels
PubMed heeft een lijst met gebruikte trefwoorden, een zogenaamde thesaurus.
In PubMed heet dit: MeSH-termen. MeSH staat voor Medical Subject Heading.
Hiermee kun je ideeën opdoen voor zoektermen.
In PubMed kun je zoeken met MeSH-termenvia de MeSH Database. MeSH-termen (Medical Subject Headings) zijn gestandaardiseerde trefwoorden, die door indexeerders aan alle artikelen in PubMed worden toegekend. Elk artikel heeft zo'n 10-20 MeSH-termen toegevoegd.
Voordelen van zoeken met MeSH-termen:
MeSH-termen worden ook toegekend aan artikelen waarin deze term niet voorkomt maar het onderwerp wel behandelen.
MeSH-termen geven inzicht in de synoniemen, deze worden Entry terms genoemd.
Het is dus verstandig om voor de verschillende elementen in je zoekvraag op zoek te gaan naar MeSH-termen.
MeSH-database
Je kunt de MeSH database vinden door op de homepagina van PubMed te klikken op MeSH database. Er zal nu een nieuw tabblad openen met de MeSH databank.
Beginscherm van PubMed
MeSH Do's en Don'ts
Do: zoek de zoekterm op in de MeSH Database, en gebruik 'add to search builder' om de MeSH-term te kopiëren naar je zoekformulier.
Don't:Simpelweg [Mesh] typen achter een zoekterm.
Voorbeeld
In deze training zullen we gebruik maken van de volgende onderzoeksvraag:
Wat is de invloed van inname van voedingsvezels op obstipatie bij volwassenen?
Voor deze onderzoeksvraag gaan we op zoek naar relevante MeSH-termen voor de elementen obstipatie en voedingsvezels. We beginnen met de MeSH-term voor obstipatie. De MeSH-databank is in het Engels, dus we zoeken op constipation in de zoekbalk. De MeSH-term die we vinden is "Constipation". Let op! Zorg dat je in de MeSH databank zit. Als bij de rode pijl PubMed staat kun je het menu openklappen en MeSH selecteren.
MeSH pagina van constipation
Om de MeSH-term te gebruiken in een zoekstring kopieer je hem naar het invulformulier zoekstrategie PubMed of een eigen Word document.
Je doet dit door:
te klikken op "Add to search builder"
het zoekcommando te kopiëren vanuit de PubMed search builder box naar het invulformulier of een Word bestand: "Constipation"[Mesh]
klik vervolgens op 'Search PubMed' om te zoeken met de MeSH-term in PubMed
MeSH pagina van constipation
1.2 MeSH-termen: kennisclip
Waar vind ik de MeSH databank?
Problemen met het kijken van de kennisclip?
Krijg je de foutmelding "Mediasite Player: your playback ticket is not valid for this session", verwijder dan je cookies en speel het filmpje opnieuw af.
1.3 MeSH-termen: oefening
Oefening: MeSH termen
0%
In deze oefening ga je zoeken naar MeSH termen in de MeSH databank. Voor het beantwoorden van de vragen moet je in de MeSH databank op zoek gaan naar de juiste MeSH-termen.
Naast MeSH-termen zoek je ook altijd op synoniemen, woorden met een gelijke betekenis, die in de titel of samenvatting voorkomen. Op deze manier vind je ook de recente artikelen. Er zit namelijk een vertraging van ongeveer 6 maanden op het toekennen van MeSH-termen aan artikelen door indexeerders. Daarom is het belangrijk om ook op synoniemen te zoeken.
Synoniemen bedenken
Synoniemen kun je zelf bedenken, maar je kunt ook gebruik maken van de MeSH databank. Op de webpagina van een MeSH-term staan onder het kopje Entry termsde synoniemen genoemd van deze MeSH term. Direct achter de synoniemen zet je [tiab]. Met dit commando geef je PubMed opdracht om enkel te zoeken naar artikelen waarin het synoniem voorkomt in de titel of abstract (=samenvatting) van het artikel.
Voorbeeld
De MeSH-term voor obstipatie is Constipation[Mesh] en op deze pagina zie je onder het kopje Entry terms twee synoniemen staan voor constipation:
MeSH pagina van constipation. Bij de rode pijl staan de synoniemen onder het kopje 'Entry Terms'.
Om de meeste recente literatuur te vinden moet je ook de MeSH-term zelf toevoegen, door hier [tiab] achter te zetten.
De synoniemen van de MeSH Term Constipation zijn dus:
Constipation[tiab]
Dyschezia[tiab]
Colonic Inertia[tiab]
1.5 Synoniemen: kennisclip
Waar vind ik synoniemen?
Problemen met het kijken van de kennisclip?
Krijg je de foutmelding "Mediasite Player: your playback ticket is not valid for this session", verwijder dan je cookies en speel het filmpje opnieuw af.
2. Zoektechnieken
Hoe moet ik zoektermen met elkaar combineren?
Het is niet handig om alle mogelijke zoektermen lukraak in te typen in PubMed.
Om specifieke en gerichte informatie over je onderwerp terug te vinden,
moet je zoektermen met elkaar combineren.
Er zijn verschillende technieken om dit te doen:
Booleaanse operatoren
Trunkeren
Exacte woordcombinatie
2.1 Zoeken met Booleaanse operatoren
Booleaanse operatoren (AND, OR, NOT)
AND
AND betekent dat alle zoekwoorden in het zoekresultaat moeten voorkomen
De AND-relatie gebruik je om twee (of meer) verschillende onderwerpen aan elkaar te linken
Het zoekresultaat wordt beperkt, kleiner ten opzichte van het zoeken op één woord
Voorbeeld: je bent op zoek naar informatie over de relatie tussen voedingsvezels en obstipatie. Zoektermen en relatie: constipation AND dietary fibers
OR
OR betekent dat ten minste één van de zoekwoorden voorkomt in het zoekresultaat
de OR-relatie gebruik je bij synoniemen, meervoud/enkelvoud, verschillende spellingsvormen
Het zoekresultaat wordt vergroot, uitgebreid ten opzichte van het zoeken op één woord
Voorbeeld: je wilt ook zoeken op de synoniemen van constipation. Zoektermen en relatie: constipation OR dyschezia
NOT
De NOT-relatie gebruik je om een bepaald woord/onderwerp uit te sluiten
het zoekresultaat wordt verkleind
Voorbeeld: je wilt informatie over omleidingen rond het hart, maar niet over maagomleidingen.
Zoektermen en relatie: bypass NOT gastric
Tips!
Type AND/OR/NOT met hoofdletters.
Combineer je meerdere Booleaanse operatoren, zet de OR-termen dan tussen haakjes.
Voorbeeld: (Constipation OR dyschezia) AND dietary fibers.
Gebruik je hier géén haakjes dan werkt het AND commando alléén voor dyschezia AND dietary fibers.
2.2 Hoe werkt trunkeren?
Trunkeren is het vervangen van een stukje van een woord door een * (wildcard). Dit betekent dat je zoekt naar woorden eindigend op het ingetypte woord.
Als je een trunkeerteken achter een (gedeelte van een) woord typt, zoek je op wat je hebt ingetypt én alles wat er achter kan staan.
Voorbeeld: Nurs* zoekt opNurseen Nursesen Nursing etc
Op deze manier kan je handig enkelvoud en meervoud tegelijk doorzoeken
Voorbeeld: Dietary fiber*zoekt op Dietary fiber enDietary fibers
Let op!
In PubMed werkt trunkeren alleen vanaf 4 letters of meer
Voorbeeld: boy* [tiab] werkt niet.
Dus maak hiervoor zelf een zoekstring: boy[tiab] OR boys[tiab] OR boyhood[tiab]
Tip!
Het is de kunst om niet té vroeg of té laat te trunkeren in een woord.
Zoek je naar informatie over "pollution" typ dan pollut* en niet poll*.
2.3 Zoeken op Exacte woordcombinatie
Wil je alleen zoekresultaten vinden waarin je ingegeven zoektermen in exact dezelfde volgorde voorkomen, zet deze zoektermen dan tussen dubbele aanhalingstekens.
Dit is handig bij begrippen die uit meerdere woorden bestaan, bv. “dietary fiber” Zet je dit begrip niet tussen aanhalingstekens dan vind je ook zoekresultaten die over een ander onderwerp gaan en waarbij de woorden dietary en fiber ergens in de tekst voorkomen.
Meer voorbeelden: "diabetes mellitus”, "food safety", "heart failure", "body weight".
Een exacte woordcombinatie is eigenlijk een strenge versie van de Booleaanse AND-operator. De zoektermen moeten wel naast elkaar staan. Een ander verschil is dat de volgorde van de zoektermen niet willekeurig is, maar door jou wordt vastgelegd.
2.4 Hoe krijg ik meer/minder zoekresultaten?
Niemand is bereid om honderden of duizenden zoekresultaten allemaal afzonderlijk te beoordelen op hun relevantie. Het is beter om zo te zoeken dat je maximaal enkele tientallen zoekresultaten krijgt, zonder relevante zoekresultaten overboord te gooien.
Wat kan je doen als je veel te veel zoekresultaten krijgt?
Gebruik andere zoektermen
Kijk welke (betere?) Mesh-termen er zijn gebruikt in een revelant artikel
Combineer belangrijke zoektermen met de Booleaanse AND-operator
Wees kritisch op het gebruik van de OR-operator
Trunkeer zo laat mogelijk in een woord; trunke*
Gebruik de Filters zo laat mogelijk om af te bakenen.
Let op: als je eenmaal een filter hebt aangezet houd PubMed dit vast en moet je die dus bij een volgende zoekaktie eerst zelf 'uitvinken'
Het is frustrerend om geen zoekresultaten te krijgen.
Wat kan je doen als je weinig of geen zoekresultaten krijgt?
Gebruik andere zoektermen.
Combineer synoniemen en vertalingen met de Booleaanse OR-operator.
Kijk welke Mesh-termen er zijn gebruikt in een revelant artikel.
Zoek breder: Kijk bij de Mesh in de structuur naar hogere termen.
Heb je gezocht op [Mesh] OR [tiab]? Zoek dan ook eens zonder deze aanduiding en kijk bij de gevonden artikelen welke Mesh-termen er daar zijn gebruikt.
Sneeuwballen; bekijk de literatuurlijst van een relevante bron om meer bronnen te vinden
Probeer andere bronnen
3. Zoekstring maken
Je kunt de zoektermen (MeSH-termen en synoniemen) met elkaar combineren door de juiste combinaties van Booleaanse operatoren en ronde haken te gebruiken.
Er zijn 2 manieren om MeSH termen en synoniemen te combineren.
Met PubMed Advanced Search Builder. Deze optie wordt uitgelegd in 3.1 en 3.2.
Met Word. Deze optie wordt uitgelegd in 3.3 en 3.4.
Met beide opties bereik je hetzelfde zoekresultaat. Een voordeel van de tweede optie is dat je hier je zoekstring gemakkelijker kunt bewaren, aanpassen en herbruiken.
Het is een kwestie van persoonlijke voorkeur of je de Advanced Search Builder of Word gebruikt.
3.1 Advanced search builder
PubMed Advanced Search Builder is een handig hulpmiddel voor het op de juiste plaats krijgen van haakjes en het gebruik van booleaanse operatoren.
Hieronder wordt uitgelegd hoe dit werkt als je een zoekstring wilt maken voor de onderzoeksvraag "Wat is de invloed van inname van voedingsvezels op obstipatie bij volwassenen?"
Stappenplan PubMed Advanced Search Builder
Stap 1:Open PubMed Advanced
Stap 2: Bij “History and Search details” staat de zoekactie naar de MeSH-term (zie 1.1 van deze training) voor het onderdeel constipatie uit de onderzoeksvraag.
Type (of kopieer) één van de synoniemen in de bovenste zoekbalk en klik op 'Add' en 'Search'
Het synoniem staat nu bij de "History and search details"
Als je meer synoniemen wilt toevoegen kun je dit doen op dezelfde manier. In het voorbeeld voegen we nog de synoniemen "Colonic Inertia" en Constipation toe. Constipation is uiteraard hetzelfde als de MeSH-term, maar door ook deze op titel en abstract te doorzoeken vind je de de meest recente literatuur.
Stap 4:Combineer de MeSH-term en synoniem(en) met elkaar
Gebruik hiervoor de 3 puntjes onder 'Actions'.
Kies bij de MeSH-term voor 'Add query'.
Bij het toevoegen van synoniemen kies je 'Add with OR'
Klik als je alle synoniemen hebt toegevoegd op 'Search'
Stap 5:Maak met behulp van stappen 1 t/m 4 ook een zoekstring voor het onderdeel voedingsvezels.
Bij search #10 zie je de zoekstring staan voor voedingsvezels.
Stap 6:Combineer de twee onderdelen (constipatie en vezels) met elkaar.
Gebruik hiervoor de 3 puntjes onder 'Actions'.
Kies bij het eerste onderdeel (= constipatie) voor 'Add query'.
Bij het toevoegen van extra onderdelen (= voedingsvezels) kies je 'Add with AND'
Klik als je alle onderdelen hebt toegevoegd op 'Search'
Resultaat
Bij search #11 staat nu de zoekstring voor de onderzoeksvraag "Wat is de invloed van inname van voedingsvezels op obstipatie bij volwassenen?"
3.2 Kennisclip Advanced search builder
Zoekstring maken met PubMed Advanced Search Builder
Hier leer je Mesh-termen en synoniemen te combineren met PubMed Advanced Search.
Dit is een handige manier om veldaanduidingen, haakjes en booleaanse operatoren op de juiste plaats te krijgen.
Problemen met het kijken van één van de kennisclips?
Krijg je de foutmelding "Mediasite Player: your playback ticket is not valid for this session", verwijder dan je cookies en speel het filmpje opnieuw af.
3.3 Word
De tweede manier om een zoekstring te maken is door gebruik te maken van Word.
Maak eventueel gebruik van het invulformulier PubMed, dat op de website van de Mediatheek staat.
Hieronder wordt uitgelegd hoe je een zoekstring maakt in Word voor de onderzoeksvraag "Wat is de invloed van inname van voedingsvezels op obstipatie bij volwassenen?"
Stappenplan zoekstring in Word
Stap 1: Identificeer de verschillende onderdelen in de onderzoeksvraag.
De voorbeeldonderzoeksvraag had de volgende elementen:
Kopieer de zoekterm vanuit de PubMed Search Builder box Voorbeeld: "Constipation"[Mesh]
Stap 3: Synoniemen van MeSH-term toevoegen
Het eerste synoniem dat je toevoegt is de MeSH-term zelf. Deze zoekterm is uiteraard hetzelfde als de MeSH-term, maar door ook deze op titel en abstract te doorzoeken vind je de de meest recente literatuur. Er zit namelijk een vertraging op het toekennen van MeSH-termen.
Achter de zoekterm typ je [tiab], dit staat voor title/abstract. Voorbeeld: Constipation[tiab]
Combineer de MeSH-term uit stap 1 met zijn synoniem hierboven. Tussen de MeSH-termen en synoniemen gebruik je OR. Voorbeeld: "Constipation"[Mesh] OR Constipation[tiab]
Kopieer de synoniemen onder 'Entry Terms' op de MeSH-pagina van Constipation
Maak gebruik van de zoektechnieken, trunkeren en exacte woordcombinatie, en zet achter de synoniemen [tiab]. Tussen synoniemen zet je de booleaanse operator OR. Voorbeeld: Dyschezia[tiab] OR "Colonic Inertia"[tiab]
Voeg deze synoniemen toe aan de zoekstring van stap 3. Voorbeeld: "Constipation"[Mesh] OR Constipation[tiab] OR Dyschezia[tiab] OR "Colonic Inertia"[tiab]
Stap 5: Plaats ronde haken
Plaats ronde haken aan het begin en einde van een onderdeel, dit doe je zodat deze zoektermen bij elkaar blijven. Voorbeeld:("Constipation"[Mesh] OR Constipation[tiab] OR Dyschezia[tiab] OR "Colonic Inertia"[tiab])
Stap 6: Maak een zoekstring voor een ander onderdeel
Herhaal stappen 1 t/m 5 voor het maken van een zoekstring voor het onderwerp voedingsvezels. Voorbeeld: ("Dietary Fiber"[Mesh] OR “Dietary Fiber*”[tiab] OR “Wheat Bran*”[tiab] OR Roughage*[tiab])
Tip!Entry terms die omkeringen zijn van vorige kan je verwijderen. Zo gebruik je "Dietary fibers" in je zoekstring en haal je "Fibers, Dietary" weg.
Stap 7: Combineer de twee onderdelen (constipatie en vezels) met elkaar.
Tussen de verschillende onderwerpen (aspecten) van een onderzoeksvraag gebruik je AND
Voorbeeld: (Constipation[Mesh] OR Constipation[tiab] OR Dyschezia[tiab] OR "Colonic Inertia"[tiab]) AND ("Dietary Fiber"[Mesh] OR "Dietary Fiber*"[tiab] OR "Wheat Bran*"[tiab] OR Roughage*[tiab])
Resultaat
(Constipation[Mesh] OR Constipation[tiab] OR Dyschezia[tiab] OR "Colonic Inertia"[tiab]) AND ("Dietary Fiber"[Mesh] OR "Dietary Fiber*"[tiab] OR "Wheat Bran*"[tiab] OR Roughage*[tiab])
3.4 Kennisclip Word
Zoekstring maken in Word
Hier leer je het combineren van zoektermen in Word met behulp van MeSH-termen.
Problemen met het kijken van één van de kennisclips?
Krijg je de foutmelding "Mediasite Player: your playback ticket is not valid for this session", verwijder dan je cookies en speel het filmpje opnieuw af.
4. Zoeken met een zoekstring
Hoe kan ik zoeken met een zoekstring in PubMed?
Je kunt de zoekstring die je gemaakt hebt in onderdeel 3 gebruiken om te zoeken in PubMed. Hoe je dat doet, wordt uitgelegd in dit deel van de training.
Kan ik mijn gemaakte zoekstring ook gebruiken in andere databanken?
Ja dat kan! Met enkele kleine aanpassingen aan de PubMed zoekstring kan je deze ook gebruiken in andere databanken. In deze training wordt voor de databanken Ebscohost (CINAHL), Cochrane Library en Springer Link uitgelegd hoe je dit kunt doen.
4.1 Zoeken in PubMed
Zoeken in PubMed kun je het gemakkelijkste doen via Advanced Search.
Hieronder wordt uitgelegd hoe je kunt zoeken met de zoekstring die gemaakt is onderdeel 3 van deze training.
Stappenplan zoeken in PubMed met een zoekstring
Stap 1:Open PubMed Advanced
Heb je de Advanced Search builder (zie onderdeel 3.1) gebruikt om je zoekstring te maken ga naar stap 2a.
Heb je Word (zie onderdeel 3.3) gebruikt om je zoekstring te maken ga naar stap 2b.
Stap 2a:Zoekstring bij 'History and Search Details'
Heb je de Advanced Search builder (zie onderdeel 3.1) gebruikt om je zoekstring te maken, dan staat je gemaakte zoekstring al bij 'History and Search Details'.
Klik op het aantal results om je resultaten (de gevonden artikelen) te bekijken.
Stap 2b:Kopieer je zoekstring in de Query box
Heb je Word (zie onderdeel 3.3) gebruikt om je zoekstring te maken, kopieer je zoekstring en plak deze in de 'Query box'
Klik op 'Search'
Stap 3:Bekijk je resultaten
Bekijk je resultaten. Zitten er relevante artikelen tussen die een antwoord geven op je onderzoeksvraag?
Zo niet, stel jezelf de volgende vragen:
Is er een zoekterm die geen goede artikelen oplevert? Haal deze eens uit je zoekstring en kijk wat dat doet met resultaten. Kijk daarnaast ook eens naar de eerste paar titels van de gevonden artikelen om zo betere zoektermen te vinden.
Kun je nog verder specificeren, bv door het toevoegen van een doelgroep of een specifiekere zoekterm? Voorbeeld: stel je zoekt informatie over diabetes type 1. Je hebt in je zoekstring enkel de zoekterm 'diabetes' staan, deze kun je specifieker maken door te zoeken naar "diabetes type 1"
Staat het trunkeerteken te vroeg, waardoor je onrelevante woordvarianten hebt gevonden?
In onderdeel 2.4 van deze training staan nog meer tips om je zoekresultaten te vergroten of te verkleinen.
4.2 Zoeken in andere databanken
Kan ik de zoekstring die ik gemaakt heb in PubMed ook gebruiken in andere databanken?
Ja! Je kan de zoekstring die je in PubMed hebt gemaakt ook gemakkelijk gebruiken in andere databanken.
Hiervoor pas je het volgende aan:
Verwijder de veldaanduidingen [MeSH] en [tiab]
Conroleer of alle samengestelde trefwoorden tussen "dubbele aanhalingstekens" staan Voorbeeld:"Dietary Fiber"
Voorbeeld zoekstring aanpassen
PubMed zoekstring gemaakt met Word: (Constipation[Mesh] OR Constipation[tiab] OR Dyschezia[tiab] OR "Colonic Inertia"[tiab]) AND ("Dietary Fiber"[Mesh] OR "Dietary Fiber*"[tiab] OR "Wheat Bran*"[tiab] OR Roughage*[tiab])
Stap 1: Verwijder [MeSH] en [tiab] aanduidingen.
(Constipation[Mesh] OR Constipation[tiab]OR Dyschezia[tiab]OR "Colonic Inertia"[tiab])AND ("Dietary Fiber"[Mesh]OR "Dietary Fiber*"[tiab]OR "Wheat Bran*"[tiab]OR Roughage*[tiab])
Stap 2: Verwijder dubbelingen. (Constipation OR Constipation OR Dyschezia OR “Colonic Inertia”) AND (“Dietary Fiber” OR “Dietary Fiber*” OR “Wheat Bran*” OR Roughage*)
Stap 3: Controleer of samengestelde trefwoorden tussen "dubbele aanhalingstekens".
Resultaat aangepaste zoekstring: (Constipation OR Dyschezia OR “Colonic Inertia”) AND (“Dietary Fiber*” OR “Wheat Bran*” OR Roughage*)
4.2.1 EBSCOhost (CINAHL)
Voordelen van het zoeken in EBSCOhost
In de EBSCOhost zitten veel full-text artikelen.
Je kunt tegelijkertijd zoeken in 4 databanken, namelijk CINAHL Complete, MEDLINE Complete, Nursing & Allied Health Collection en Psychology and Behavioral Sciences Collection.
Selecteer 'Medical' om te zoeken in de vier medische databanken
Stap 2:Plak de aangepaste zoekstring in de zoekbalk
Knip en plak het eerste aspect van je zoekvraag (Constipation OR Dyschezia OR “Colonic Inertia”) in de 1ste zoekbox.
Knip en plak (“Dietary Fiber*” OR “Wheat Bran*” OR Roughage*) in de 2e zoekbox.
Zorg ervoor dat je de juiste Boolean Operator selecteert, in dit geval AND
Gebruik evt. "Select a Field" om je zoekactie de specificeren.
Zoeken in "Abstract" geeft bijvoorbeeld een specifieker resultaat als het zoeken in "All text"
4.2.2 Cochrane Library
Zoeken in Cochrane library
PubMed en Cochrane library maken gebruik van dezelfde MeSH-databank. Echter moet je wel de MeSH-termen en synoniemen opnieuw opzoeken in de Cochrane Library.
Zoeken van MeSH-termen
Ga naar het tabblad Medical terms (MeSH) en geef in de zoekbalk de MeSH-term in die je gebruikt hebt in je PubMed zoekstring. Voorbeeld: Constipation.
Klik vervolgens op look up (1) en add to search manager (2).
Zoeken van synoniemen
De synoniemen zoek je op in het tabblad Search. Noteer in de zoekbalk de synoniemen die je gebruikt hebt in je PubMed zoekstring. Vervolgens klik je op Send to search manager. Let op!
Haal [tiab] weg
* en "...." kun je wel laten staan
MeSH-termen en synoniemen combineren
Voor het combineren van de MeSH-termen en de synoniemen kijk je bij het tabblad Search manager. Hier staat nu de MeSH-term Constipation in veld #1 en de synoniemen in veld #2. Deze twee velden kun je met elkaar combineren met de Booleaanse operator OR door in veld #3 te noteren: #1 OR #2.
Vervolgens klik je op continue voor het resultaat van je zoekopdracht.
Tip:Het zoeken in Cochrane levert vaak weinig andere artikelen op die je niet al PubMed hebt gevonden.
4.2.3 Springer Link
Zoeken in Springer Link
Gebruik voor het zoeken in Springer Link de eerste zoekbalk op de startpagina van de databank.
Knip en plak hierin de gehele zoekstrategie (let op: zonder [Mesh] en [tiab]). Gebruik het loepje om de zoekactie te starten.
Tip! Springer Link bevat naast Engelse ook Nederlandse literatuur, als je deze ook wilt vinden, vertaal dan je zoektermen in het Nederlands en voeg die toe met OR.
Let op: Je zoekt in Springer Link alleen in de literatuur die is uitgegeven door de uitgever Springer, probeer altijd artikelen te vinden vanuit meerdere bronnen.
5. Tips & Tricks
5.1 Filters
Filters
Filters in PubMed
Wanneer je te veel resultaten krijgt, kun je via filters je zoekactie verder inperken. Je voert hiervoor eerst de zoekactie uit en vervolgens kun je in de linkerbalk een aantal filters aanklikken. Door deze filters in te stellen zoekt PubMed alleen binnen bepaalde soorten publicaties of binnen bepaalde tijdsperiodes.
Let op! Maak voor een compleet literatuuronderzoek alleen gebruik van de filters: Systematic Review (publicationtype), Date (publicatiedatum) en Language (taal). Maak ook geen gebruik van de filter "Free full text"!
Additional Filters
Onder de knop 'Show additional filters' zijn nog meer filters beschikbaar, bijvoorbeeld taal en leeftijdsgroepen. Door hier de filters van je voorkeur aan te klikken worden ze aan de linkerzijde geplaatst zodat je ze kan aanvinken voor het inperken van je zoekresultaat.
Age filter activeren door het aanvinken van leeftijdsgroepen
Tips!
Veel filters zijn gebaseerd op MeSH-termen. Daardoor kun je
veel recente, nog niet-geïndexeerde artikelen missen.
Wil je geen nieuwe literatuur missen? Maak dan alleen gebruik van de standaard filters: Systematic Review (publicationtype), Date (publicatiedatum) en Language (taal).
Meer weten over filters? Kijk dan in de training Evidence Based Practice.
Filters die je instelt voor je zoekactie blijven geldig voor alle volgende zoekacties die je doet. Ze worden enkel inactief als je ze zelf verwijdert.
Gebruik enkel filters als je te veel resultaten krijgt. Het gebruik van filters zorgt namelijk voor een sterke inperking van je resultaten.
Gebruik niet het filter 'Free full text'. Als je dit filter gebruikt sluit je namelijk niet-full text resultaten uit, waardoor je veel relevante informatie zult missen.
5.2 Verwijzen
Cite
De knop 'Cite' (aan de rechterkant van een geopend artikel) geeft een titelbeschrijving van het artikel welke gebruikt kan worden in de literatuurlijst. Selecteer Format "APA" rechtsonderaan voor een beschrijving volgens de APA regels.
Permalink
De knop geeft een directe link naar het artikel, gebruik deze als je snel toegang tot het artikel wilt geven.
Cite en Permalink
5.3 Zoekresultaten sorteren
Display options
De knop 'Display options' (rechtsboven in de resultatenlijst) geeft de mogelijkheid om het resultaat te sorteren.
Kies "Most recent" voor een overzicht op datum waarop de artikelen zijn toegevoegd aan de PubMed database.
Kies "Best match" voor een overzicht met de meest relevante artikelen eerst.
Display options
5.4 Clinical Queries
Naast de filters kun je ook gebruik maken van vooraf ingestelde zoekfilters. Je vindt deze door op het beginscherm van PubMed onder 'Find'te klikken op de optie Clinical Queries.
Klik op Clinical Queries
in het beginscherm van
PubMed
Er zal nu een scherm openen met een grijze zoekbalk 'Please enter search term(s)'. In deze zoekbalk voer je je PubMed zoekstring in. Na het invoeren hiervan krijg je onder de balk drie filters te zien:
1. Clinical Study Categories. Hier kun je aangegeven naar welk type onderzoek je wilt zoeken, bijvoorbeeld etiology, diagnosis, therapy, prognosis of clinical prediction guides. Ook kun je aanklikken of je zoekactie broad moet zijn, dat wil zeggen sensitief (= je krijgt dan veel resultaten, waarvan veel niet relevant). Of dat je zoekactie narrow moet zijn, dat wil zeggen specifiek (= je krijgt dan minder resultaten, maar relevantere).
2. Systematic Reviews.Via dit filter vind je gemakkelijk systematic reviews voor je zoekactie. Onder deze filter vallen systematic reviews, meta-analyses, reviews van clinical trials en guidelines.
3. Medical Genetics.Met deze clinical querie filter kun je filteren op het onderwerp medische genetica. Daarnaast kun je ook nog kiezen voor andere onderwerpen binnen dit thema, waaronder diagnose en genetisch testen.
5.5 Zoekstring opslaan
Hoe sla ik mijn zoekstring op?
Problemen met het kijken van de kennisclip?
Krijg je de foutmelding "Mediasite Player: your playback ticket is not valid for this session", verwijder dan je cookies en speel het filmpje opnieuw af.
6. Full text
Hoe vind je de full text van een in PubMed gevonden artikel?
PubMed is een bibliografische databank, dit houd in dat er voornamelijk beschrijvingen van literatuur in PubMed opgenomen worden en geen full text. Daarom is er aan de toegang naar PubMed via de mediatheek een linkresolver toegevoegd. Deze zorgt ervoor dat er bij de artikelen die je vindt in PubMed een link komt naar de artikelen die wel full text aanwezig zijn in andere databanken waar de mediatheek een licentie voor heeft.
Tip!Gebruik dus altijd de toegang tot PubMed via de mediatheek.
Doorloop de volgende stappen voor full text:
1. PubMed bevat ook gratis Open Access artikelen.
Maak er gebruik van als het kan, sorteer hier echter niet op, dit doet afbreuk aan het resultaat van je zoekaktie.
2. Door de linkresolver wordt er een knop bij ieder zoekresultaat in PubMed geplaatst. Hiermee krijg je direct het volledige artikel wanneer dit beschikbaar is in een andere databank van de mediatheek.
3. Check of het artikel elders online beschikbaar is via Google Scholar. Knip en plak eenvoudigweg de titel van het PubMed artikel in de zoekbalk van Google Scholar.
4. Is het artikel op geen van de voorgaande manieren te vinden. Keer dan terug via de knop, naar de WorldCat Linkresolver pagina. Hier kun je het artikel aanvragen via IBL met de knop. De mediatheek gaat het artikel dan voor je opvragen bij een andere bibliotheek.
Tip! Werk je buiten de Hogeschool gebouwen dan is het handig om de Library Access plug-in aan je browser toe te voegen, dan heb je overal eenvoudig toegang tot full text artikelen in de databanken van de mediatheek.
7. Hulpmiddel: EndNote
Bibliografische software
Wanneer je een onderzoeksopdracht of scriptie maakt, verzamel je veel informatie. Om het overzichtelijk te houden én automatische verwijzingen te maken, kun je bibliografische software gebruiken.
Er zijn gratis online tools die een verwijzing genereren die je kan kopiëren. Met de meer geavanceerde programma's kan je literatuurverwijzingen en pdf-documenten verzamelen, opslaan, delen en organiseren. Je bewaart op deze manier je eigen bibliografische databank met referenties. Daarnaast bieden deze programma’s meestal een plug-in waarmee je literatuurlijsten en tekstverwijzingen in Word kunt invoegen. Word heeft ook een eigen ingebouwde referentie functie. Deze biedt minder mogelijkheden dan bibliografische software. Hogeschool Rotterdam heeft een licentie afgesloten voor het programma EndNote.
EndNote
EndNote is bibliografische software waarmee je automatisch verwijzingen en literatuurlijsten kunt maken in een citatiestijl naar keuze. Met het programma houd je overzicht over je verzamelde informatie. EndNote ondersteunt meer dan 500 stijlen, waaronder APA en MLA. Studenten en medewerkers van Hogeschool Rotterdam kunnen EndNote gratis installeren via Liquit.
Kijk voor toegang tot EndNote en meer informatie op de mediatheekwebsite onder Tools.
Heb je hulp nodig bij je zoekstrategie in PubMed aarzel dan niet om contact op te nemen met de mediatheek. Kijk voor contact gegevens op https://hr.nl/mediatheek
Do you need help with your PubMed search? Do not hesitate to contact the library.
Begrippenlijst
Term
Uitleg
Meer informatie
Abstract
Korte samenvatting van een artikel, deze staat vaak bovenaan het artikel na de vermelding van titel en auteurs
Aspect
Onderwerp / Onderdeel van je vraag
Auteur
De schrijver(s) van een publicatie zoals een artikel of een boek
Bibliografie
De gegevens die je nodig hebt om een artikel, boek etc. te vinden, o.a. titel, auteur, jaar van uitgave, isbn
Experts / wetenschappers op een onderwerpsgebied die trefwoorden toekennen aan artikelen/boeken
Informatievaardigheden
Alles wat je moet weten om goed naar literatuur te kunnen zoeken en verwijzen
Keyword
Trefwoord; een kenmerkend woord waarop je kunt zoeken naar literatuur
Literatuur
Artikelen, boeken, rapporten en andere geschreven uitingen waarin het resultaat van (wetenschappelijk) onderzoek of de stand van zaken in de wetenschap wordt gepubliceerd
Literatuurlijst
Lijst met gebruikte artikelen, boeken en andere gepubliceerde uitingen
Lijst met gebruikte trefwoorden in rangorde van groot naar klein
tiab
Afkorting voor titel - abstract. Wordt gebruikt als [tiab] of [Title/Abstract], hiermee wordt aangegeven dat PubMed alleen moet zoeken naar de zoekterm in het titel en abstract-veld.
Vervangen van een stukje van de zoekterm door een * (sterretje). Je zoekt dan naar het woord wat je intyped en alles wat erachter komt (bijvoorbeeld nurs* zoekt naar nurse/nurses/nursing etc.)
Dit lesmateriaal is gepubliceerd onder de Creative Commons Naamsvermelding 4.0 Internationale licentie. Dit houdt in dat je onder de voorwaarde van naamsvermelding vrij bent om:
het werk te delen - te kopiëren, te verspreiden en door te geven via elk medium of bestandsformaat
het werk te bewerken - te remixen, te veranderen en afgeleide werken te maken
voor alle doeleinden, inclusief commerciële doeleinden.
Van dit lesmateriaal is de volgende aanvullende informatie beschikbaar:
Toelichting
Zelfstandig te doorlopen training gericht op het vergroten van informatievaardigheiden in PubMed. De training bestaat uit 5 modules. Iedere module bevat uitleg en soms korte video's. Je kan de modules van begin tot eind doorlopen of onafhankelijk van elkaar doen.
Zelfstandig te doorlopen training gericht op het vergroten van informatievaardigheiden in PubMed. De training bestaat uit 5 modules. Iedere module bevat uitleg en soms korte video's. Je kan de modules van begin tot eind doorlopen of onafhankelijk van elkaar doen.
Trunkeren is het vervangen van een stukje van een woord door een 
Wil je alleen zoekresultaten vinden waarin je ingegeven zoektermen in exact dezelfde volgorde voorkomen, zet deze zoektermen dan tussen dubbele aanhalingstekens.
geeft een directe link naar het artikel, gebruik deze als je snel toegang tot het artikel wilt geven.
knop bij ieder zoekresultaat in PubMed geplaatst. Hiermee krijg je direct het volledige artikel wanneer dit beschikbaar is in een andere databank van de mediatheek.
knop. De mediatheek gaat het artikel dan voor je opvragen bij een andere bibliotheek.
