Er zijn meerdere soorten desinfectiemiddel, maar de meest toegepaste in de voedingsmiddelenindustrie zijn:
Quat heeft als voordeel dat het materialen niet aantast. Echter micro-organismen kunnen resistent worden voor dit middel, waardoor ze niet meer dood gaan. Daarom wordt quat eens per week afgewisseld met chloorbleekloog.