## 7.4 Identificatie - deel III

7. We gaan de eerste hit CASA1_BOVIN verder analyseren. Klik op het gekleurde balkje en daarna nog een keer op het tweekleurige balkje. Bekijk de gegevens.

Je ziet een zogenaamde 'alignment' van twee aminozuursequenties. Q (query) is de sequentie van jouw zoekvraag, in dit geval kandidaat1. S is de eiwitsequentie uit de database die het meest op kandidaat1 lijkt, in dit geval CASA1_BOVIN.

De regel tussen de 2 sequenties bevat de letters van de identieke aminozuren tussen Q en S. Als niet alle aminozuren hetzelfde zijn tussen Q en S zie je hier 'gaten' vallen.

Je kunt zien dat de volgorde van kandidaat1 voor 100% overeenkomt met de volgorde van CASA1_BOVIN, het alfa-S1-caseine eiwit (alle 199 aminozuren zijn identiek). Je hebt dus één van de vier eiwitten geïdentificeerd!

8. Klik op CASA1_BOVIN. Je gaat nu naar de database en ziet de gegevens die bekend zijn over dit eiwit. Vul voor kandidaat1 het formulier in je werkdocument 'CSI Genomics Formulier Screening Verdachte Eiwitten' in. Maak gebruik van de informatie die je vindt bij:

- Protein name
- From; zoek ook de Nederlandse naam op in onderstaande lijst met organismen.
- Keywords
- Comments

9. Doe nu zelf een BLAST search met sequenties van de andere 3 gevonden eiwitten en vul de resultaten in op het formulier in je werkdocument.

Wat is nu je eindconclusie over de moord? Waaraan is het slachtoffer overleden? Vul deze eindconclusie in op het formulier in je werkdocument.