## 7.3 Identificatie - deel II

4. Klik op "Run BLAST" (rechts bovenaan).

5. Als de zoektocht klaar is, zie je een balkje met resultaten dat lijkt op wat hieronder staat:

Deze output betekent dat er 101 hits zijn gevonden in de database SwissProt, d.w.z. er zijn 101 eiwitten gevonden waarvan de aminozuurvolgorde lijkt op die van kandidaat1. Het getal dat je ziet bij e-Value geeft aan hoe goed het beste resultaat is. Als dit getal heel klein is (en dat is in dit geval zo: het is 3,7 x 10-113), betekent dat dat het een betrouwbaar resultaat is.

Let op: Deze lijst met BLAST resultaten kun je altijd later weer oproepen via "BLAST results" (in de balk bovenaan) om naar de resultaten van de verschillende kandidaten te kijken.

6. Klik nu de regel aan (hij verandert van kleur) om naar de gevonden resultaten te kijken.

Je ziet nu een scherm met de zogenaamde hitlist, de lijst van eiwitsequenties die gevonden zijn in de database SwissProt en die lijken op kandidaat1. Op nummer 1 staat de sequentie uit de database die het meest lijkt op (of zelfs identiek is aan) jouw ingevoerde sequentie kandidaat1. De code van deze sequentie is CASA1_BOVIN.

Van links naar rechts lees je op elke regel de output van een van de hits:

- Nr: Het nummer van het gevonden resultaat. Op nummer 1 staat de beste hit, etc.
- ID: Dit is de code van de gevonden eiwitsequentie uit de database. Het eerste deel (bij de eerste hit 'casa1') slaat op de naam van het eiwit. Het tweede deel van de naam (bij de eerste hit "bovin") wordt gevormd door een afkorting van het organisme, in dit geval "bovine". Zoek op welk organisme dit is.
- Coverage: Hier zie je in kleur welk deel van jouw zoeksequentie (kandidaat1) overeenkomt met de database sequentie (die is in grijs gegeven). Op de eerste regel zie je dat jouw zoeksequentie van begin tot eind overeenkomt met CASA1_BOVIN.
- Description: de tekstuele omschrijving van de database sequentie die gevonden is als antwoord op jouw vraag.
- Hsps, Bitscore en E-value: Getallen die het programma berekent en die jou een idee kunnen geven over hoe betrouwbaar het resultaat is. De beste hit staat bovenaan.