De aanwezigheidsregistratie op het Nova College wordt vastgelegd in Magister. Iedere docent behoort dit tijdens de les direct in Magister te registreren. Op deze manier kan een SLBer snel zien als een van zijn studenten ongeoorloofd afwezig is. De regels voor het ziek- en beter melden van studenten staat op de Welkomstpagina voor studenten op NovaPortal. Om het verzuim in te perken is er een verzuimprotocol dat geldt voor het hele Nova College.