In prokaryote cellen is er géén compartimentering in celorganellen die door een membraan omsloten worden. Het DNA van prokaryoten is ook niet opgesloten binnen een kernmembraan maar ligt los in het cytoplasma. Het DNA van prokaryoten is niet opgerold rond eiwitten (naakt DNA). Een celwand en celmembraan zijn wel aanwezig. Ribosomen komen voor, maar hebben een andere structuur dan bij eukaryoten. Het prokaryote celtype vind je bij bacteriën en archaea.