Controleer het dier regelmatig op een goede gezondheid, dit kan wekelijks met een uitgebreide gezondheidscontrole en dagelijks observeer je het dier tijdens het voeren. Een gezond konijn is een actief, oplettend dier dat graag eet en een schone en droge vacht heeft. Aanwijzingen dat je konijn ziek is, zijn: erg rustig, niet willen eten, vuile ogen, een vuile neus, een vieze vacht rond de anus, kwijlen, jeuk, kale plekken en het schuin houden van de kop.
Een belangrijke aanwijzing over de gezondheid van je konijn zijn de keutels. Zijn deze klein en hard dan wijst dit op een naderende verstopping of te weinig eten. Te zachte, natte keutels wijzen op darmklachten. Vaak wordt dit veroorzaakt door verkeerde voeding. Ook andere gezondheidsproblemen, zoals olifantstanden en vetzucht, kun je deels voorkomen door een verantwoorde voeding met voldoende ruwvoer.
Als je konijn niet eet, moet je dezelfde dag nog naar de dierenarts gaan: te lang wachten kan dodelijk zijn, en bijvoeding is vrijwel altijd nodig.
Niet of slecht eten kan verschillende oorzaken hebben, zoals pijn, stress of gebitsproblemen. Als er niet snel iets aan gedaan wordt, kunnen de darmen van het konijn stil gaan liggen en daar kan het dier aan overlijden.
Er komen twee gevaarlijke besmettelijke ziekten voor bij konijnen: myxomatose en VHD. Myxomatose is een ziekte waarbij het konijn verdikte ogen, verdikte geslachtsopeningen en bulten (myxomen) in de huid krijgt. Het virus wordt met name overgedragen via stekende insecten (bv de mug, de vlo en de vlieg). Ook kan de ziekte door direct contact worden overgedragen (via wilde konijnen).
Virale hemorrhagische diarree is een virusziekte die met name door direct contact via ontlasting, urine en speeksel, maar ook via schoeisel en kleding kan worden overgedragen. De konijnen worden snel ziek met bloederige uitvloeiing uit alle lichaamsopeningen. Deze ziekten zijn vrijwel altijd dodelijk. Je moet je konijnen dan ook jaarlijks hiertegen laten inenten. Aangeraden wordt om dit in de maanden april of mei te laten doen, zodat je konijn goed beschermd is voor de zomer en herfstperiode.