Leren onderzoeken moet niet verward worden met onderzoekend leren'. Bij onderzoekend leren ligt de nadruk op het verwerven van kennis binnen een bepaald vakgebied, via een leerweg waarin de leerling actieve (zoekende) taken uitvoert. Bij leren onderzoeken ligt de nadruk op het leren kennen van het werk van (wetenschappelijke) onderzoekers, via een leerweg waarbij leerlingen bestaand onderzoek analyseren en eigen onderzoeken uitvoeren.