Het proces waarbij ammonium door bacteriën wordt omgezet in nitraat noemt men nitrificatie. Producenten gebruiken nitraat en ammonium om organische stikstofverbindingen zoals chlorofyl, aminozuren en DNA te maken. Dit proces heet stikstofassimilatie. Dieren gebruiken de organische stikstofverbindingen van planten en andere dieren. Rottingsbacteriën zetten dood organisch materiaal om in ammoniak. Via oplossingen in water en nitrificatie wordt dat dan omgezet in nitraat en nitraat wordt door denitrificerende bacteriën omgezet in stikstofgas en dat proces heet “denitrificatie”.
Ammonificatie: Het proces waarbij organisch stikstof wordt omgezet in ammonium
Nitrificatie: Het proces waarbij ammonium wordt omgezet in nitriet/nitraat
Denitrificatie: Het proces waarbij nitraat wordt omgezet in stikstofgas