pH optimum

Elk enzym heeft een bepaalde pH waarbij zijn structuur optimaal is. Voor veel enzymen ligt dat pH-optimum  bij pH 7, maar het enzym peptase in je maag b.v. werkt het best bij een veel lagere pH.
Als de pH teveel afwijkt, worden bindingen onherstelbaar beschadigd. Het enzym verliest definitief zijn vorm: het denatureert.

Ook nucleïnezuren zijn heel gevoelig voor veranderingen in de pH, door de aanwezigheid van waterstofbruggen tussen de stikstofbasen.