Cofactor en coenzym

In het actieve centrum komen vaak speciale hulpstoffen voor die een rol spelen bij de scheikundige reactie.
We noemen deze hulpstoffen cofactoren als ze anorganisch zijn en co-enzymen als ze organisch zijn.
Het eiwitachtige deel van het enzym wordt apo-enzym genoemd.

Cofactoren kunnen bepaalde ionen zijn zoals ijzer, calcium of chloor. In het hemoglobine uit de rode bloedlichaampjes worden ijzeratomen (als cofactor) gebruikt bij de binding van zuurstof. Veel vitaminen werken als co-enzym bij enzymreacties.

De cofactoren en co-enzymen dragen eraan bij dat een enzym vaak maar één chemische reactie kan uitvoeren. Zij maken een enzym dus reactiespecifiek.