PubMed training (Avans Hogeschool)

Training PubMed

Waarom deze training?Bron: E. Langhorst, Hogeschool Rotterdam

PubMed is een gratis doorzoekbare databank met referenties van biomedische literatuur. PubMed doorzoekt literatuurreferenties vanaf 1946 en wordt dagelijks bijgewerkt door de National Library of Medicine (NLM) in de VS.

 

Wat kun je vinden in PubMed?

  • Meer dan 30 miljoen beschrijvingen (records) van medisch wetenschappelijke artikelen.
  • uit ca 5600 peer-reviewed biomedische tijdschriften

 

Tip! Gebruik altijd de toegang tot PubMed via de Xplora-website.

 

Wat leer je in deze training?

Deze training is gericht op het vergroten van je informatievaardigheiden in PubMed. Daarnaast zul je zien dat de zoekstrategie die je maakt in PubMed ook toe te passen is in andere databanken. De training is bedoeld voor HBO-studenten verpleegkunde en fysiotherapie. Er is geen specifieke voorkennis nodig om deel te nemen.​

Je leert:

  • zoekwoorden zoeken in de trefwoordenstructuur (MeSH);
  • synoniemen zoeken en tiab gebruiken;
  • een zoekstring maken;

 

Zo werkt het:

De training bestaat uit 7 modules. Iedere module bevat uitleg en soms korte video's. Je kan de modules van begin tot eind doorlopen of onafhankelijk van elkaar doen. Klik op de knop 'Volgende' rechts onderin dit scherm om te starten.


De makers
Informatiespecialisten van Hogeschool Rotterdam hebben deze training ontwikkeld (zie colofon).
Hij is enigszins aangepast voor Avans-studenten

 

 

1. Verzamel zoektermen

Bron: HR, E, Langhorst

Vertaal je hoofdvraag en deelvragen naar bruikbare zoektermen waarmee je gaat zoeken naar informatie.

Vind je het lastig om geschikte zoektermen te bedenken? Maak dan gebruik van de volgende tips:

  • Je vindt goede zoektermen door relevante artikelen te scannen op algemene begrippen.
  • Tijdens de oriëntatiefase kom je vaak vakterminologie en Engelse termen tegen. Noteer deze termen alvast.
  • Gebruik woordenboeken om zoektermen te vertalen, bijvoorbeeld naar het Engels
  • Je kunt een synoniemenwebsite raadplegen.
  • PubMed heeft een lijst met gebruikte trefwoorden, een zogenaamde thesaurus.
    In PubMed heet dit: MeSH-termen. MeSH staat voor Medical Subject Heading.
    Hiermee kun je ideeën opdoen voor zoektermen.

 

1.1 Zoek MeSH-termen

Wat zijn MeSH-termen?

In PubMed kun je zoeken met MeSH-termen via de MeSH Database. MeSH-termen (Medical Subject Headings) zijn gestandaardiseerde trefwoorden, die door indexeerders aan alle artikelen in PubMed worden toegekend. Elk artikel heeft zo'n 10-20 MeSH-termen toegevoegd.

Voordelen van zoeken met MeSH-termen:

  • MeSH-termen worden ook toegekend aan artikelen waarin deze term niet voorkomt maar het onderwerp wel behandelen.
  • MeSH-termen zoeken ook tegelijkertijd op synoniemen, deze worden Entry terms genoemd.

Het is dus verstandig om voor de verschillende elementen in je zoekvraag op zoek te gaan naar MeSH-termen.

 

MeSH-database
Je kunt de MeSH database vinden door op de homepagina van PubMed te klikken op MeSH database. Er zal nu een nieuw tabblad openen met de MeSH databank.

Beginscherm van PubMed

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

MeSH Do's  en Don'ts

Do: zoek de zoekterm op in de MeSH Database, en gebruik 'add to search builder' om de MeSH-term te kopiëren naar je zoekformulier.

Don't: Simpelweg [Mesh] typen achter een zoekterm.

 


Voorbeeld

In deze training zullen we gebruik maken van de volgende onderzoeksvraag:

Wat is de invloed van inname van voedingsvezels op obstipatie bij volwassenen?

Voor deze onderzoeksvraag gaan we op zoek naar relevante MeSH-termen voor de elementen obstipatie en voedingsvezels. We beginnen met de MeSH-term voor obstipatie. De MeSH-databank is in het Engels, dus we zoeken op constipation in de zoekbalk. De MeSH-term die we vinden is "Constipation".
Let op! Zorg dat je in de MeSH databank zit. Als bij de rode pijl PubMed staat kun je het menu openklappen en MeSH selecteren.

MeSH pagina van constipation



Om de MeSH-term te gebruiken in een zoekstring kopieer je hem naar het invulformulier zoekstrategie PubMed of een eigen Word document.

Je doet dit door:

  • te klikken op "Add to search builder"
  • het zoekcommando te kopiëren vanuit de PubMed search builder box naar het invulformulier of een Word bestand: "Constipation"[Mesh]
MeSH pagina van constipation

 

1.2 MeSH-termen: kennisclip

Waar vind ik de MeSH databank? En hoe kan ik zoeken op MeSH-termen?

 

Overgenomen uit: PubMed Wikiwijs van Hogeschool Rotterdam

1.3 MeSH-termen: oefening

1.4 Zoek synoniemen

Bron: HR, E, Langhorst

Naast MeSH-termen zoek je ook altijd op vrije tekst termen, ook wel synoniemen genoemd. Op deze manier vind je ook de recente artikelen. Er zit namelijk een vertraging van ongeveer 6 maanden op het toekennen van MeSH-termen aan artikelen door indexeerders. Daarom is het belangrijk om ook op synoniemen te zoeken.

 

Synoniemen en [tiab]

Synoniemen kun je zelf bedenken, maar je kunt ook gebruik maken van de MeSH databank. Op de webpagina van een MeSH-term staan onder het kopje Entry terms de synoniemen genoemd van deze MeSH term. Direct achter de synoniemen zet je [tiab]. Met dit commando geef je PubMed opdracht om enkel te zoeken naar artikelen waarin het woord voorkomt in de titel of abstract (=samenvatting) van het artikel.

 


Voorbeeld

De MeSH-term voor obstipatie is Constipation[Mesh] en op deze pagina zie je onder het kopje Entry terms twee synoniemen staan voor constipation:  

MeSH pagina van constipation. Bij de rode pijl staan de synoniemen onder het kopje 'Entry Terms'.

 

Om de meeste recente literatuur te vinden moet je ook de MeSH-term zelf toevoegen, door hier [tiab] achter te zetten.

De synoniemen van de MeSH Term Constipation zijn dus:

  • Constipation[tiab]
  • Dyschezia[tiab]
  • Colonic Inertia[tiab]

1.5 Synoniemen: kennisclip

Waar vind ik synoniemen?

 

Download eventueel het invulformulier zoekstrategie PubMed (Word)


Problemen met het kijken van de kennisclip?
Krijg je de foutmelding "Mediasite Player: your playback ticket is not valid for this session", verwijder dan je cookies en speel het filmpje opnieuw af.

 

 

 

1.6 Extra: PubMed tutorial zoeken met MeSH

In deze interactieve kennisclip wordt (in het Engels) uitgelegd hoe je op onderwerp kunt zoeken in PubMed. Het gebruik van MeSH-termen komt ook aan bod.

 

2. Zoektechnieken

Hoe moet ik zoektermen met elkaar combineren?

Het is niet handig om alle mogelijke zoektermen lukraak in te typen in PubMed.
Om specifieke en gerichte informatie over je onderwerp terug te vinden,
moet je zoektermen met elkaar combineren.

Er zijn verschillende technieken om dit te doen:

  • Booleaanse operatoren
  • Trunkeren
  • Exacte woordcombinatie

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

2.1 Zoeken met Booleaanse operatoren

Booleaanse operatoren (AND, OR, NOT)

AND

  • AND betekent dat alle zoekwoorden in het zoekresultaat moeten voorkomen
  • De AND-relatie gebruik je om twee (of meer) verschillende onderwerpen aan elkaar te linken
  • Het zoekresultaat wordt beperkt, kleiner ten opzichte van het zoeken op één woord
  • Voorbeeld: je bent op zoek naar informatie over de relatie tussen voedingsvezels en obstipatie. Zoektermen en relatie: constipation AND dietary fibers

 

 

 

 

 

 

 


OR

  • OR betekent dat ten minste één van de zoekwoorden voorkomt in het zoekresultaat
  • de OR-relatie gebruik je bij synoniemen, meervoud/enkelvoud, verschillende spellingsvormen
  • Het zoekresultaat wordt vergroot, uitgebreid ten opzichte van het zoeken op één woord
  • Voorbeeld: je wilt ook zoeken op de synoniemen van constipation. Zoektermen en relatie: constipation OR dyschezia

 

 

 

 

 

 

 

 

NOT

  • De NOT-relatie gebruik je om een bepaald woord/onderwerp uit te sluiten
  • het zoekresultaat wordt verkleind
  • Voorbeeld: je wilt informatie over omleidingen rond het hart, maar niet over maagomleidingen.
    Zoektermen en relatie: bypass NOT gastric













Tips!

  • Type AND/OR/NOT met hoofdletters.
  • Combineer je meerdere Booleaanse operatoren, zet de OR-termen dan tussen haakjes.
    Voorbeeld: (Constipation OR dyschezia) AND dietary fibers.
    Gebruik je hier géén haakjes dan werkt het AND commando alléén voor dyschezia AND dietary fibers.

 

 

 

2.2 Hoe werkt trunkeren?

Trunkeren is het vervangen van een stukje van een woord door een * (wildcard). Dit betekent dat je zoekt naar woorden eindigend op het ingetypte woord.
 

  • Als je een trunkeerteken achter een (gedeelte van een) woord typt, zoek je op wat je hebt ingetypt én alles wat er achter kan staan.
    Voorbeeld: Prevent* zoekt op prevent en preventie en preventief en prevention etc
  • Op deze manier kan je handig enkelvoud en meervoud tegelijk doorzoeken
    Voorbeeld: Dietary fiber* zoekt op Dietary fiber en Dietary fibers
  • Als je zoekt naar een woord wat op verschillende manieren kan worden geschreven kan een ? je helpen. Voorbeeld: Behavio?r zoekt naar behavior en behaviour


Tip!

Het is de kunst om niet té vroeg of té laat te trunkeren in een woord.
Zoek je naar informatie over "pollution" typ dan pollut* en niet poll*.

2.3 Zoeken op Exacte woordcombinatie

Wil je alleen zoekresultaten vinden waarin je ingegeven zoektermen in exact dezelfde volgorde voorkomen, zet deze zoektermen dan tussen dubbele aanhalingstekens.

Dit is handig bij begrippen die uit meerdere woorden bestaan, bv. “dietary fiber” Zet je dit begrip niet tussen aanhalingstekens dan vind je ook zoekresultaten die over een ander onderwerp gaan en waarbij de woorden dietary en fiber ergens in de tekst voorkomen.

Meer voorbeelden: "diabetes mellitus”, "gezond gewicht", "food safety", "job satisfaction", "heart failure".

 

Een exacte woordcombinatie is eigenlijk een strenge versie van de Booleaanse AND-operator. De zoektermen moeten wel naast elkaar staan. Een ander verschil is dat de volgorde van de zoektermen niet willekeurig is, maar door jou wordt vastgelegd.

2.4 Hoe krijg ik meer/minder zoekresultaten?

Niemand is bereid om honderden of duizenden zoekresultaten allemaal afzonderlijk te beoordelen op hun relevantie. Het is beter om zo te zoeken dat je maximaal enkele tientallen zoekresultaten krijgt, zonder relevante zoekresultaten overboord te gooien.

Wat kan je doen als je veel te veel zoekresultaten krijgt?Beeld: E. Langhorst, Hogeschool Rotterdam

  • Gebruik meer of andere zoektermen
  • Kijk welke (betere?) Mesh-termen er zijn gebruikt in een revelant artikel
  • Combineer belangrijke zoektermen met de Booleaanse AND-operator
  • Wees kritisch op het gebruik van de OR-operator
  • Trunkeer zo laat mogelijk in een woord; trunke*
  • Gebruik de Filters zo laat mogelijk om af te bakenen (Filter bijvoorbeeld op Age bij "Additional filters"). Let op: als je eenmaal een filter hebt aangezet houd PubMed dit vast en moet je die dus bij een volgende zoekaktie eerst zelf 'uitvinken'


Het is frustrerend om geen zoekresultaten te krijgen.

Wat kan je doen als je weinig of geen zoekresultaten krijgt?Beeld: E. Langhorst, Hogeschool Rotterdam

  • Combineer synoniemen en vertalingen met de Booleaanse OR-operator
  • Gebruik minder of andere zoektermen
  • Kijk welke Mesh-termen er zijn gebruikt in een revelant artikel
  • Zoek breder: Kijk bij de Mesh in de structuur naar hogere termen.
  • Heb je gezocht op [Mesh] OR [tiab]?
  • Sneeuwballen; bekijk de literatuurlijst van een relevante bron om meer bronnen te vinden
  • Probeer andere bronnen
  • Kijk ook eens op het AGZ-blog voor meer tips

3 Combineren van zoektermen

3.1 Combineren van Mesh termen en synoniemen

Combineren van Mesh termen en synoniemen met behulp van PubMed Advanced

Dit is een handig hulpmiddel voor het op de juiste plaats krijgen van haakjes en het gebruik van booleaanse operatoren.

 

Stap 1: Open PubMed Advanced

 

 

Stap 2: Bij “History and Search details” staat de zoekactie naar de Meshterm  (zie 1.1 van deze training)

 

 

Stap 3: Selecteer Title/Abstract
Tik (of kopieer) één van de synoniemen in de bovenste zoekbalk, in dit geval “Dyschezia”
Klik Add en Search

 

 

Stap 4: Combineer Search 1 en 2

Gebruik hiervoor de 3 puntjes … onder “Actions” en “Add query”
Let op de juiste combinatie AND/OR/NOT (kies OR bij synoniemen)
Klik Search

 

Resultaat:

 

3.2 Kennisclip combineren van zoektermen

Hoe combineer ik zoektermen?

3.3 Kennisclips Xplora

4. Zoekstring

Zoekstring maken in PubMed

Je kunt de zoektermen (MeSH-termen en synoniemen) met elkaar combineren door de juiste combinaties van Booleaanse operatoren en ronde haken te gebruiken. Hierna kan je de zoekstring kopiëren naar PubMed en zoeken naar relevante informatie.

 

Zoekstring in andere databanken gebruiken

Het maken van een zoekstring vanuit de MeSH-termen in PubMed kan je helpen bij het zoeken in andere databanken. Met enkele kleine aanpassingen aan de PubMed zoekstring kan je deze ook gebruiken in bijvoorbeeld CINAHL of Cochrane library.

4.1 Zoekstring maken in PubMed

MeSH-termen en synoniemen combineren

Gebruik de juiste combinaties van Booleaanse Operatoren:

  • Tussen de MeSH-termen en synoniemen gebruik je OR
  • Tussen de verschillende onderwerpen (aspecten) gebruik je AND

​Start en sluit elke aspect met ronde haken (   ).

Tip! Als je je zoekstrategie wilt bewaren voor het zoeken in andere databanken (of voor je verslag) werk dan in Word.

 


Voorbeeld

De voorbeeldonderzoeksvraag had de volgende elementen:

  1. Constipation
  2. Dietary Fibers

 

Stappenplan voor het maken van een zoekopdracht in PubMed

  1. Start vanuit de gevonden MeSH term.
    Klik op "Add to search builder" en kopieer het zoekcommando vanuit de PubMed Search Builder box
    Voorbeeld: "Dietary Fiber"[Mesh]

 

 

 

 

 

 

       

       2. Voeg hieraan toe dat je ook naar deze term wilt zoeken in de nieuwe literatuur met [tiab]
           Voorbeeld: "Dietary Fiber"[Mesh] OR “Dietary Fiber*”[tiab]

       3. Selecteer en kopieer de synoniemen onder het kopje Entry terms

       4. Splits de termen uit, maak hierbij slim gebruik van trunceren * en phrase searching "...."
           Voorbeeld: "Dietary fiber*" zoekt naar "Dietary fiber" en "Dietary fibers"

      5. Entry terms die omkeringen zijn van vorige kan je verwijderen
          Voorbeeld: "Dietary fibers" behouden en "Fibers, Dietary" verwijderen

      6. Zet achter elke Entry term [tiab] zodat je in het titelveld en abstract veld zoekt

      7. Synoniemen combineer je met OR

 

Je zoekopdracht voor dietary fiber is:
"Dietary Fiber"[Mesh] OR “Dietary Fiber*”[tiab] OR “Wheat Bran*”[tiab] OR Roughage*[tiab]

 

Als je constipation op dezelfde manier uitwerkt dan ziet de volledige zoekstring voor de onderzoeksvraag
"Wat is de invloed van inname van voedingsvezels op obstipatie bij volwassenen?" er zo uit.

Volledige zoekstring voor onderzoeksvraag:
(Constipation[Mesh] OR Constipation[tiab] OR Dyschezia[tiab] OR "Colonic Inertia"[tiab]) AND ("Dietary Fiber"[Mesh] OR "Dietary Fiber*"[tiab] OR "Wheat Bran*"[tiab] OR Roughage*[tiab])

 


 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

4.2 Zoeken met de zoekstring

Zoeken in PubMed met de zoekstring

Zoeken in PubMed kun je het beste doen via het Advanced zoekscherm.
Dit scherm vind je door onder de algemene zoekbalk te klikken op Advanced.

 

Stap 1: Open het PubMed Advanced zoekscherm.

Advanced scherm in PubMed openen

 

Stap 2: Knip en plak je zoekstrategie in de zoekbox.

Plak je zoekstrategie in de zoekbox. Klik Search.

Tip! Werk per element, dan kan je zien wat de zoekresultaten zijn en of je ergens een (typ)foutje hebt gemaakt.

Plak de zoekstring voor dietary fiber in de zoekbox en klik Search

 

Stap 3: Ga terug naar Advanced om je volgende zoekelement toe te voegen.
Plak ook deze zoekstring in de zoekbox en klik search.

Plak de zoekstring voor constipation in de zoekbox.



Stap 4: Zoekacties combineren.
Ga terug naar Advanced, bij "History and Search details" staan beide zoekacties.
Gebruik ... (de 3 puntjes voor elke zoekstring) om beide zoekelementen in de zoekbox te combineren (in dit geval met AND). Klik Search.

Selecteer ... en Add with AND

 

 

Als je meerdere zoekelementen wilt combineren werk dan op dezelfde manier verder.
Let wel op de combinaties met AND / OR.
Voorbeeld: Constipation en Facial Impaction zijn synoniemen, combineer deze zoekelementen met OR

Selecteer Add with OR bij synoniemen

 

 

 

 

 

 

 

 

4.3 Zoekstring in andere databanken

Je kan de zoekstring die je in PubMed hebt gemaakt ook gemakkelijk gebruiken in andere databanken.

Hiervoor pas je het volgende aan:

  • Verwijder de veldaanduidingen [MeSH] en [tiab]
  • Conroleer of alle samengestelde trefwoorden tussen "dubbele aanhalingstekens" staan
    Voorbeeld: "Dietary Fiber"

 

Je kunt dan in andere databanken de "Advanced" search openen en de gehele zoekstrategie erin plakken of dit per onderwerp doen, let wel op de booleaanse operatoren en veldaanduidingen.

 


Voorbeeld

PubMed zoekstring:
(Constipation[Mesh] OR Constipation[tiab] OR Dyschezia[tiab] OR "Colonic Inertia"[tiab]) AND ("Dietary Fiber"[Mesh] OR "Dietary Fiber*"[tiab] OR "Wheat Bran*"[tiab] OR Roughage*[tiab])

 

Voorbeeld aangepaste zoekstring:
(Constipation OR Dyschezia OR “Colonic Inertia”) AND (“Dietary Fiber*” OR “Wheat Bran*” OR Roughage*)

 

 

Zoeken in databank CINAHL

Knip en plak het eerste aspect van je zoekvraag (Constipation OR Dyschezia OR “Colonic Inertia”) in de 1ste zoekbox.
Knip en plak (“Dietary Fiber*” OR “Wheat Bran*” OR Roughage*) in de 2e zoekbox.
Zorg ervoor dat je de juiste Boolean Operator selecteert, in dit geval AND

 

Gebruik evt. "Select a Field" om je zoekactie de specificeren.
Zoeken in "Abstract" geeft bijvoorbeeld een specifieker resultaat als het zoeken in "All text"

 

 

 

5 PubMed tips & tricks

5.1 Filters

Filters

Filters in PubMed

Wanneer je te veel resultaten krijgt, kun je via filters je zoekactie verder inperken. Je voert hiervoor eerst de zoekactie uit en vervolgens kun je in de linkerbalk een aantal filters aanklikken. Door deze filters in te stellen zoekt PubMed alleen binnen bepaalde soorten publicaties of binnen bepaalde tijdsperiodes. Onder de knop 'Show additional filters' zijn nog meer filters beschikbaar, bijvoorbeeld taal en leeftijdsgroepen.  

Tips!

  • Gebruik enkel filters als je te veel resultaten krijgt. Het gebruik van filters zorgt namelijk voor een sterke inperking van je resultaten. Daarnaast kun je ook veel recente, nog niet-geïndexeerde artikelen missen, omdat veel filters gebaseerd zijn op MeSH-termen.
  • Als je filters instelt voor je zoekactie blijven deze geldig voor alle volgende zoekacties die je doet. Ze worden enkel inactief als je ze zelf verwijdert.
  • Gebruik niet het filter 'Free full text'. Als je dit filter gebruikt sluit je namelijk niet-full text resultaten uit, waardoor je veel relevante informatie zult missen. Meer informatie op het AGZ-blog.

 

 

 

 

 

 

 

 

 


Clinical Queries

Naast de filters kun je ook gebruik maken van vooraf ingestelde zoekfilters. Je vindt deze door op het beginscherm van PubMed onder 'Find' te klikken op de optie Clinical Queries.

Klik op Clinical Queries
in het beginscherm van
PubMed

Er zal nu een scherm openen met een grijze zoekbalk 'Please enter search term(s)'. In deze zoekbalk voer je je PubMed zoekstring in. Na het invoeren hiervan krijg je onder de balk drie filters te zien:

1. Clinical Study Categories. Hier kun je aangegeven naar welk type onderzoek je wilt zoeken, bijvoorbeeld etiology, diagnosis, therapy, prognosis of clinical prediction guides. Ook kun je aanklikken of je zoekactie broad moet zijn, dat wil zeggen sensitief (= je krijgt dan veel resultaten, waarvan veel niet relevant). Of dat je zoekactie narrow moet zijn, dat wil zeggen specifiek (= je krijgt dan minder resultaten, maar relevantere).

2. Systematic Reviews. Via dit filter vind je gemakkelijk systematic reviews voor je zoekactie. Onder deze filter vallen systematic reviews, meta-analyses, reviews van clinical trials en guidelines.

3. Medical Genetics. Met deze clinical querie filter kun je filteren op het onderwerp medische genetica. Daarnaast kun je ook nog kiezen voor andere onderwerpen binnen dit thema, waaronder diagnose en genetisch testen.

 

 

5.2 Verwijzen

Cite

De knop 'Cite' (aan de rechterkant van een geopend artikel) geeft een titelbeschrijving van het artikel welke gebruikt kan worden in de literatuurlijst. Selecteer Format "APA" rechtsonderaan voor een beschrijving volgens de APA regels.

 

Permalink

De knop geeft een directe link naar het artikel, gebruik deze als je snel toegang tot het artikel wilt geven.

Cite en Permalink
 

5.3 Zoekresultaten sorteren

Display options

De knop 'Display options' (rechtsboven in de resultatenlijst) geeft de mgelijkheid om het resultaat te sorteren.
Kies "Most recent" voor een overzicht met de nieuwste artikelen eerst.
Kies "Best match" voor een overzicht met de meest relevante artikelen eerst.

 

Display options
 

5.4 Clinical Queries

Naast de filters kun je ook gebruik maken van vooraf ingestelde zoekfilters. Je vindt deze door op het beginscherm van PubMed onder 'Find' te klikken op de optie Clinical Queries.

Klik op Clinical Queries
in het beginscherm van
PubMed

Er zal nu een scherm openen met een grijze zoekbalk 'Please enter search term(s)'. In deze zoekbalk voer je je PubMed zoekstring in. Na het invoeren hiervan krijg je onder de balk drie filters te zien:

1. Clinical Study Categories. Hier kun je aangegeven naar welk type onderzoek je wilt zoeken, bijvoorbeeld etiology, diagnosis, therapy, prognosis of clinical prediction guides. Ook kun je aanklikken of je zoekactie broad moet zijn, dat wil zeggen sensitief (= je krijgt dan veel resultaten, waarvan veel niet relevant). Of dat je zoekactie narrow moet zijn, dat wil zeggen specifiek (= je krijgt dan minder resultaten, maar relevantere).

2. Systematic Reviews. Via dit filter vind je gemakkelijk systematic reviews voor je zoekactie. Onder deze filter vallen systematic reviews, meta-analyses, reviews van clinical trials en guidelines.

3. Medical Genetics. Met deze clinical querie filter kun je filteren op het onderwerp medische genetica. Daarnaast kun je ook nog kiezen voor andere onderwerpen binnen dit thema, waaronder diagnose en genetisch testen.

5.5 Zoekstring opslaan

6. Full text

Hoe vind je de full text van een in PubMed gevonden artikel?

PubMed is een bibliografische databank, dit houd in dat er voornamelijk beschrijvingen van literatuur in PubMed opgenomen worden en geen full text. Daarom is er aan de toegang naar PubMed via Xplora een linkresolver toegevoegd. Deze zorgt ervoor dat er bij de artikelen die je vindt in PubMed een link komt naar de artikelen die wel full text aanwezig zijn in andere databanken waar de mediatheek een licentie voor heeft.

Tip! Gebruik dus altijd de toegang tot PubMed via Xplora.

 

Doorloop de volgende stappen voor full text:

1. Door de linkresolver wordt er een full-text "START" knop in PubMed knop bij ieder zoekresultaat in PubMed geplaatst. Hiermee krijg je direct het volledige artikel wanneer dit beschikbaar is in een databank van Xplora.

2. Check of het artikel elders online beschikbaar is via Google Scholar. Knip en plak eenvoudigweg de titel van het PubMed artikel in de zoekbalk van Google Scholar.

3. PubMed bevat ook gratis artikelen (free full text). Maak er gebruik van als het kan, maar filter hier echter niet op, je mist dan betaalde content van Xplora.

4. Werk je buiten de Hogeschool gebouwen dan is het handig om de Lean library Access plug-in aan je browser toe te voegen, dan heb je overal eenvoudig toegang tot full text artikelen in de databanken van Xplora.

5. Is het artikel op geen van de voorgaande manieren te vinden, dan kun je het (voor 2,50) aanvragen bij Xplora via xplora@avans.nl. Het artikel wordt dan voor je aangevraagd bij een andere bibliotheek.

 

 

 

 

7. Refworks

Bibliografische software

Wanneer je een onderzoeksopdracht of scriptie maakt, verzamel je veel informatie. Om het overzichtelijk te houden én automatische verwijzingen te maken, kun je bibliografische software gebruiken.

Er zijn gratis online tools die een verwijzing genereren die je kan kopiëren. Met de meer geavanceerde programma's kan je literatuurverwijzingen en pdf-documenten verzamelen, opslaan, delen en organiseren. Je bewaart op deze manier je eigen bibliografische databank met referenties. Daarnaast bieden deze programma’s meestal een plug-in waarmee je literatuurlijsten en tekstverwijzingen in Word kunt invoegen. Word heeft ook een eigen ingebouwde referentie functie. Deze biedt minder mogelijkheden dan bibliografische software. Xplora biedt toegang tot RefWorks.

 


Refworks

RefWorks is een tool voor bronverwijzen. Je kunt er literatuurlijsten mee aanmaken een citatiestijl naar keuze. Met RefWorks verzamel en beheer je je bronverwijzingen eenvoudig online. Geen installatie noodzakelijk: alleen een optionele add-on voor je browser en tekstverwerkingsprogramma. RefWorks is cloud-based. Je hebt dus geen synchronisatieproblemen wanneer je op verschillende computers werkt. Daarnaast is het eenvoudiger in gebruik.
 

Kijk voor toegang tot RefWorks en meer informatie op https://xplora.avans.nl/cursussen/refworks

  • Het arrangement PubMed training (Avans Hogeschool) is gemaakt met Wikiwijs van Kennisnet. Wikiwijs is hét onderwijsplatform waar je leermiddelen zoekt, maakt en deelt.

    Auteur
    Pubmed
    Laatst gewijzigd
    2021-09-14 17:00:34
    Licentie

    Dit lesmateriaal is gepubliceerd onder de Creative Commons Naamsvermelding 4.0 Internationale licentie. Dit houdt in dat je onder de voorwaarde van naamsvermelding vrij bent om:

    • het werk te delen - te kopiëren, te verspreiden en door te geven via elk medium of bestandsformaat
    • het werk te bewerken - te remixen, te veranderen en afgeleide werken te maken
    • voor alle doeleinden, inclusief commerciële doeleinden.

    Meer informatie over de CC Naamsvermelding 4.0 Internationale licentie.

    Deze WikiWijs is gemaakt door Hogeschool Rotterdam, Team PubMed

    Aangepast voor Avans Hogeschool door Xplora (23-06-2021)

    Bronnen:

    Blog Xplora voor AGZ: https://xploravooragz.blogspot.com

    Libguides RUG: https://libguides.rug.nl/c.php?g=531668&p=3637442

    Stappenplan Zoekstrategie, Mediatheek Hogeschool Rotterdam: Zoekstrategie

    Training Stappenplan literatuuronderzoek, Mediahteek Hogeschool Rotterdam: https://maken.wikiwijs.nl/131972/Training__Stappenplan_literatuuronderzoek  

     

    Aanvullende informatie over dit lesmateriaal

    Van dit lesmateriaal is de volgende aanvullende informatie beschikbaar:

    Toelichting
    Zelfstandig te doorlopen training gericht op het vergroten van informatievaardigheiden in PubMed. De training bestaat uit 7 modules. Iedere module bevat uitleg en soms korte video's. Je kan de modules van begin tot eind doorlopen of onafhankelijk van elkaar doen.
    Leerniveau
    HBO - Master; HBO - Bachelor;
    Eindgebruiker
    leerling/student
    Moeilijkheidsgraad
    gemiddeld
    Trefwoorden
    informatievaardigheid, literatuuronderzoek, pubmed, zoekmethodes, zoektechnieken

    Gebruikte Wikiwijs Arrangementen

    Team IvG support Hogeschool Rotterdam. (2020).

    PubMed training

    https://maken.wikiwijs.nl/157678/PubMed_training

  • Downloaden

    Het volledige arrangement is in de onderstaande formaten te downloaden.

    Metadata

    LTI

    Leeromgevingen die gebruik maken van LTI kunnen Wikiwijs arrangementen en toetsen afspelen en resultaten terugkoppelen. Hiervoor moet de leeromgeving wel bij Wikiwijs aangemeld zijn. Wil je gebruik maken van de LTI koppeling? Meld je aan via info@wikiwijs.nl met het verzoek om een LTI koppeling aan te gaan.

    Maak je al gebruik van LTI? Gebruik dan de onderstaande Launch URL’s.

    Arrangement

    Oefeningen en toetsen

    MeSH termen

    IMSCC package

    Wil je de Launch URL’s niet los kopiëren, maar in één keer downloaden? Download dan de IMSCC package.

    QTI

    Oefeningen en toetsen van dit arrangement kun je ook downloaden als QTI. Dit bestaat uit een ZIP bestand dat alle informatie bevat over de specifieke oefening of toets; volgorde van de vragen, afbeeldingen, te behalen punten, etc. Omgevingen met een QTI player kunnen QTI afspelen.

    Versie 2.1 (NL)

    Versie 3.0 bèta

    Meer informatie voor ontwikkelaars

    Wikiwijs lesmateriaal kan worden gebruikt in een externe leeromgeving. Er kunnen koppelingen worden gemaakt en het lesmateriaal kan op verschillende manieren worden geëxporteerd. Meer informatie hierover kun je vinden op onze Developers Wiki.