DNA databases

Navigene

MRS zoekmachine RU Nijmegen (opd 37)

AMINOZUURVOLGORDE VAN MYOGLOBINE (myoglobin) HORSE - elk aminozuur heeft een naam van 3 letters (LEU - Leucine); de meeste databases gebruiken een codering met 1 letter (L - Leucine)        

SEQRES   1 A  153  GLY LEU SER ASP GLY GLU TRP GLN GLN VAL LEU ASN VAL              
SEQRES   2 A  153  TRP GLY LYS VAL GLU ALA ASP ILE ALA GLY HIS GLY GLN              
SEQRES   3 A  153  GLU VAL LEU ILE ARG LEU PHE THR GLY HIS PRO GLU THR              
SEQRES   4 A  153  LEU GLU LYS PHE ASP LYS PHE LYS HIS LEU LYS THR GLU              
SEQRES   5 A  153  ALA GLU MET LYS ALA SER GLU ASP LEU LYS LYS HIS GLY              
SEQRES   6 A  153  THR VAL VAL LEU THR ALA LEU GLY GLY ILE LEU LYS LYS              
SEQRES   7 A  153  LYS GLY HIS HIS GLU ALA GLU LEU LYS PRO LEU ALA GLN              
SEQRES   8 A  153  SER HIS ALA THR LYS HIS LYS ILE PRO ILE LYS TYR LEU              
SEQRES   9 A  153  GLU PHE ILE SER ASP ALA ILE ILE HIS VAL LEU HIS SER              
SEQRES  10 A  153  LYS HIS PRO GLY ASP PHE GLY ALA ASP ALA GLN GLY ALA              
SEQRES  11 A  153  MET THR LYS ALA LEU GLU LEU PHE ARG ASN ASP ILE ALA              
SEQRES  12 A  153  ALA LYS TYR LYS GLU LEU GLY PHE GLN GLY    

Hieronder de aminozuurvolgorde in HEMOGLOBINE. Iedere letter staat voor 1 aminozuur. In binas kun je de betekenis hiervan vinden.

VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGEYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAVAHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSK

Clustal Omega (vervangt ClustalW2)

Emboss Needle: vergelijken van eiwitcodes (opd 39)

Jmol - 3D structuur van eiwitten (opd 41)

Naam van het gen zoeken (opd 42)

Fylogenetische stamboom (opd 43)