Het is niet altijd makkelijk om zaad van vruchtgroenten te oogsten. Zaad van de komkommer wordt bijvoorbeeld met een boor geoogst. Bij de zaadoogst van tomaten, paprika en meloen moet de vrucht worden gebroken zonder dat het zaad beschadigt.
Als de pulp met het zaad uit de vrucht gehaald is, wordt het zaad van het pulp gescheiden met een zaadextractiemachine. In de eerste passeerzeef de grove vruchtdelen van de zaden gescheiden van de kleinere delen. Uiteindelijk houd je een waterig mengsel over waarin de zaden zitten. Door bijvoorbeeld te fermenteren, te spoelen en te desinfecteren krijg je uiteindelijke de zaden in handen. De laatste stap in dit proces is dan het centrifugeren van de zaden en het droogproces.